More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4756 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
264 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  77.19 
 
 
264 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  34.31 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  35.89 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.88 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1101  transcriptional regulator, DeoR family  38.25 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4348  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  33.85 
 
 
262 aa  128  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4102  DeoR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
262 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4141  DeoR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
262 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.76 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1034  DeoR family transcriptional regulator  38.25 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.631262  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.64 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
258 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  33.05 
 
 
258 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  33.05 
 
 
258 aa  126  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.64 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  33.64 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.64 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  33.64 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.64 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  33.64 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.64 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0693  transcriptional regulator, DeoR family  32.22 
 
 
269 aa  126  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0183  DeoR-family transcriptional regulator  33.19 
 
 
255 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.341023  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
274 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  35.94 
 
 
254 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0179  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
255 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0196  DeoR-family transcriptional regulator  33.19 
 
 
255 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.841984  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0188  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
255 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333156  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0180  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
255 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.73 
 
 
257 aa  125  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.18 
 
 
269 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  32.3 
 
 
253 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
261 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  28.86 
 
 
254 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
253 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.44 
 
 
261 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03718  hypothetical protein  32.44 
 
 
261 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  32.44 
 
 
261 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4349  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.44 
 
 
267 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4236  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.44 
 
 
267 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627699  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5331  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  32.44 
 
 
269 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4303  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.44 
 
 
267 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4414  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.44 
 
 
267 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  32.48 
 
 
276 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4269  DeoR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
261 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4258  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.44 
 
 
267 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
285 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2235  DeoR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
259 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859699  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  31.47 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  34.73 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.64 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  36.77 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
252 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
254 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
254 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  27.46 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  32.64 
 
 
258 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
263 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  33.73 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  30.42 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  33.06 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  28.85 
 
 
252 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1048  DeoR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
257 aa  115  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  31.87 
 
 
250 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  32.51 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  29.55 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  35.27 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4973  transcriptional regulator, DeoR family  36.02 
 
 
273 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0890746  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  30.13 
 
 
253 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  33.33 
 
 
278 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2210  DeoR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
259 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  35.53 
 
 
253 aa  113  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  29.88 
 
 
255 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  33.48 
 
 
258 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0383  DeoR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
254 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  33.76 
 
 
266 aa  112  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3258  DeoR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
251 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000943791  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  32.03 
 
 
267 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  27.42 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  31.3 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0603  DeoR family transcriptional regulator  29.34 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  31.82 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>