More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0079 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  100 
 
 		 256 aa  512  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4020  transcriptional regulator, DeoR family  53.17 
 
 		 255 aa  259  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472549  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 252 aa  145  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.3 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  31.3 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  31.3 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  30.89 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  31.73 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.1 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0500413 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  29.92 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  29.91 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4490  regulatory protein, DeoR  29.6 
 
 		 254 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2802  DeoR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.364979  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  29.48 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  36.13 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  31 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6947  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 256 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  29.2 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  29.2 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  29.2 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.2 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.2 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1542  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.2 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6287  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.353232 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  30.6 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.2 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.2 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4526  DeoR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  29.37 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  30.13 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  32.38 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  30.13 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  27.54 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 247 aa  122  8e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.17 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 261 aa  121  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 261 aa  121  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  28.99 
 
 		 257 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  28.8 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  27.57 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  30.13 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  27.08 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  33.64 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  24.9 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6903  DeoR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  28.98 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  28.98 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 253 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  31.67 
 
 		 254 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2594  DeoR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 253 aa  118  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  28.63 
 
 		 252 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  27.2 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5327  transcriptional regulator, DeoR family  26.69 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607169 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  26.38 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  27 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4870  DeoR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.69583 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  29.13 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  27.46 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.44 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.44 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.44 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.44 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  26.5 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  25.49 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  24.49 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0179  DeoR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0180  DeoR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0188  DeoR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0196  DeoR-family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.841984  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  29.57 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>