More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0321 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
252 aa  496  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  84.13 
 
 
252 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0039  transcriptional regulator, DeoR family  39.92 
 
 
247 aa  198  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000112771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  40.8 
 
 
248 aa  189  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  40.73 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  35.86 
 
 
258 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  33.2 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  35.6 
 
 
254 aa  164  9e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1796  lactose phosphotransferase system repressor  35.6 
 
 
251 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  34.96 
 
 
250 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2266  lactose phosphotransferase system repressor  32 
 
 
263 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2227  DeoR family transcriptional regulator  32 
 
 
263 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  37.05 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  34.87 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 
258 aa  125  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.52 
 
 
257 aa  125  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  34.3 
 
 
254 aa  125  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  28.69 
 
 
256 aa  123  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  32.38 
 
 
256 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0277  transcriptional regulator, DeoR family  35.83 
 
 
245 aa  122  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  31.64 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  31.23 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  29.31 
 
 
260 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  27.6 
 
 
248 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  34.54 
 
 
257 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  28.4 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
265 aa  115  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  27.71 
 
 
266 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
248 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  35.07 
 
 
248 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  28.87 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  32.65 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  28.99 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4020  transcriptional regulator, DeoR family  33.06 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472549  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2488  transcriptional regulator, DeoR family  27.78 
 
 
265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0035  transcriptional regulator, DeoR family  30.49 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000906536  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  32.78 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0975  LacR family lactose transport regulator  30.73 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  30.12 
 
 
250 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
250 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
250 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2210  DeoR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
259 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  27.46 
 
 
259 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  30.12 
 
 
250 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
259 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  29.25 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
257 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
266 aa  112  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  30.52 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  27.42 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.58 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2958  transcriptional regulator, DeoR family  29.92 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00162277  decreased coverage  0.000126005 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  30.6 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2802  DeoR family transcriptional regulator  34.32 
 
 
262 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.364979  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.87 
 
 
252 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2643  DeoR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00470761  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  31.06 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  23.93 
 
 
254 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0603  DeoR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
254 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  32.05 
 
 
252 aa  109  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  31.12 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
260 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
260 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  27.6 
 
 
250 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  28 
 
 
261 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  28 
 
 
261 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
263 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  26.67 
 
 
254 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2184  DeoR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
253 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
257 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
256 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  28 
 
 
261 aa  106  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  30.74 
 
 
250 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
253 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1024  DeoR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
254 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0617  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
244 aa  105  6e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0340612  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  28.19 
 
 
257 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  31.45 
 
 
263 aa  105  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  25.94 
 
 
257 aa  105  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
261 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.45 
 
 
278 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2235  DeoR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
259 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859699  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  26.34 
 
 
264 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  27.97 
 
 
253 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4973  transcriptional regulator, DeoR family  27.62 
 
 
273 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0890746  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>