More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5331 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5331  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  100 
 
 
269 aa  547  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.464213 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 
261 aa  530  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
261 aa  530  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4269  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
261 aa  530  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03718  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  530  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  99.62 
 
 
261 aa  528  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4258  glycerol-3-phosphate regulon repressor  89.02 
 
 
267 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4349  glycerol-3-phosphate regulon repressor  89.02 
 
 
267 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4236  glycerol-3-phosphate regulon repressor  89.02 
 
 
267 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627699  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4414  glycerol-3-phosphate regulon repressor  89.02 
 
 
267 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4303  glycerol-3-phosphate regulon repressor  89.02 
 
 
267 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4348  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  71.54 
 
 
262 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4141  DeoR family transcriptional regulator  71.54 
 
 
262 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4102  DeoR family transcriptional regulator  71.54 
 
 
262 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  44.72 
 
 
252 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  44.72 
 
 
252 aa  229  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  44.72 
 
 
252 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  44.72 
 
 
252 aa  229  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  44.72 
 
 
252 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  44.72 
 
 
252 aa  229  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  44.72 
 
 
252 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  44.72 
 
 
252 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  44.72 
 
 
252 aa  229  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  44.72 
 
 
252 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  44.72 
 
 
252 aa  229  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  44.72 
 
 
252 aa  229  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  44.72 
 
 
252 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  44.31 
 
 
252 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  43.09 
 
 
252 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  44.67 
 
 
257 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  44.08 
 
 
251 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  44.08 
 
 
251 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  44.08 
 
 
286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  44.08 
 
 
251 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  42.23 
 
 
256 aa  221  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  40.41 
 
 
252 aa  221  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  44.87 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  43.27 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  44.87 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  42.86 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  42.11 
 
 
252 aa  219  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1024  DeoR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
254 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  41.13 
 
 
252 aa  217  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  41.46 
 
 
263 aa  215  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  41.87 
 
 
252 aa  215  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  42.04 
 
 
251 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  42.15 
 
 
261 aa  215  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  41.87 
 
 
252 aa  214  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1439  transcriptional regulator, DeoR family  40.57 
 
 
275 aa  214  8e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0159016  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  41.87 
 
 
252 aa  214  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  41.87 
 
 
252 aa  214  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  41.46 
 
 
252 aa  214  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  42.86 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2210  DeoR family transcriptional regulator  41.31 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0374  transcriptional regulator, DeoR family  42.11 
 
 
262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.300794  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  41.15 
 
 
255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
252 aa  212  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  40.64 
 
 
256 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  44 
 
 
284 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  42 
 
 
259 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  40.55 
 
 
263 aa  209  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2235  DeoR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
259 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859699  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0383  DeoR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
254 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  40.24 
 
 
252 aa  209  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  40.24 
 
 
252 aa  209  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2323  DeoR family transcriptional regulator  42.45 
 
 
254 aa  208  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387167  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  40.4 
 
 
255 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3731  regulatory protein, DeoR  41.3 
 
 
254 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  39.92 
 
 
257 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0603  DeoR family transcriptional regulator  42.51 
 
 
254 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
259 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  43.27 
 
 
266 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  42.45 
 
 
277 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2979  transcriptional regulator, DeoR family  39.92 
 
 
257 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
263 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
253 aa  202  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  38.25 
 
 
270 aa  201  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  39.44 
 
 
259 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3044  glycerol-3-phosphate regulon repressor transcription regulator protein  41.74 
 
 
261 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453979  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  41.63 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0199  glycerol-3-phosphate transcriptional regulator  39.84 
 
 
263 aa  195  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464707  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  40.85 
 
 
259 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0191  glycerol-3-phosphate regulon repressor  39.43 
 
 
314 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.276628  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  40.85 
 
 
278 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  41.28 
 
 
278 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  38.15 
 
 
260 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  40.85 
 
 
278 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  40.85 
 
 
259 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3729  transcriptional regulator, DeoR family  39.83 
 
 
267 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  40.85 
 
 
259 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  40.85 
 
 
259 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  40.85 
 
 
259 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  41.42 
 
 
294 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
259 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
290 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
294 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  41.95 
 
 
259 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>