More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1034 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1034  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.631262  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1101  transcriptional regulator, DeoR family  93.75 
 
 		 257 aa  484  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1023  DeoR family transcriptional regulator  94.47 
 
 		 202 aa  378  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4365  transcriptional regulator, DeoR family  58.09 
 
 		 262 aa  271  6e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3564  DeoR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 264 aa  191  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0635844  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6108  DeoR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5960  DeoR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6957  DeoR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6298  DeoR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 268 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.7128 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5838  DeoR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1531  DeoR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 268 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0561  transcriptional regulator, DeoR family  42.97 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.725961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4425  DeoR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 258 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612915  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2591  DeoR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.759776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  37.65 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  41.02 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 274 aa  148  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  34.9 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  34.9 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.58 
 
 		 269 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.01 
 
 		 269 aa  139  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.6 
 
 		 269 aa  139  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  32.68 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  33.6 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.6 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.6 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  33.6 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.6 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.44 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.44 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  35.02 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  35.02 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.02 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  35.02 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.02 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.79 
 
 		 269 aa  135  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.02 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.44 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.54 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.44 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.44 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.44 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.44 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  35.55 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4503  DeoR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 257 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259499  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4361  DeoR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 256 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.14783  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  33.46 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4362  DeoR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0187642  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3840  DeoR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.897226  hitchhiker  0.000196031 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.18 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4306  transcriptional regulator, DeoR family  35.66 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3265  transcriptional regulator, DeoR family  38.84 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213162  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 253 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3952  DeoR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 256 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00923928  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  38.25 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4235  DeoR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00275113  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4482  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000793967 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 268 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  36.32 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  36.05 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.91 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  33.99 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4893  DeoR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6212  transcriptional regulator, DeoR family  33.72 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  0.761019 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  34.12 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4742  DeoR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3921  DeoR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 260 aa  121  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230254  normal  0.0231627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4013  DeoR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 256 aa  121  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  31.01 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4126  DeoR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.138481  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  33.59 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  33.46 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  36.33 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2456  transcriptional regulator, DeoR family  37.27 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2626  DeoR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  33.75 
 
 		 258 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  32.77 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  30.74 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  32.81 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  34.29 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>