More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3454 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 252 aa  500  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  84.13 
 
 		 252 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0039  transcriptional regulator, DeoR family  42.34 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000112771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  41.77 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  39.02 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  41.13 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  34.8 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  35.06 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1796  lactose phosphotransferase system repressor  36.8 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  35.15 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2227  DeoR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2266  lactose phosphotransferase system repressor  32.03 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  30.13 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  34.38 
 
 		 252 aa  132  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0277  transcriptional regulator, DeoR family  37.39 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  27.89 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  28.81 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  29.71 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  33.33 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  31.08 
 
 		 257 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  30.74 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  30.99 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  33.05 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 		 266 aa  118  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0718  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 254 aa  118  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000222584  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  31.95 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  28.88 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  28.85 
 
 		 264 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4020  transcriptional regulator, DeoR family  34.05 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472549  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2488  transcriptional regulator, DeoR family  28.24 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  29.22 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  28.23 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.45 
 
 		 259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  29.1 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.39 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  27.39 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  25.74 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  27.39 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  27.39 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  32.05 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  32.93 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  29.96 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0708  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  32.23 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  27.87 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  35.07 
 
 		 248 aa  111  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 255 aa  111  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  28.7 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0975  LacR family lactose transport regulator  32.14 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  28.4 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  28.39 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  32.27 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2958  transcriptional regulator, DeoR family  29.53 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00162277  decreased coverage  0.000126005 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  29.17 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  31.54 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1537  DeoR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000092764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  27.2 
 
 		 276 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2184  DeoR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388105 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  31.16 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 250 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  26.64 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  30.56 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  30.56 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1070  transcriptional regulator, DeoR family  28.8 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167958  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0196  DeoR-family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.841984  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0179  DeoR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0188  DeoR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0693  transcriptional regulator, DeoR family  27.39 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  27.87 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0180  DeoR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>