More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2396 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
249 aa  509  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  86.75 
 
 
250 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  85.94 
 
 
250 aa  447  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  85.94 
 
 
250 aa  447  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  85.94 
 
 
250 aa  448  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  85.94 
 
 
250 aa  447  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  85.54 
 
 
250 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  85.14 
 
 
250 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  85.54 
 
 
250 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  85.54 
 
 
250 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  85.54 
 
 
250 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  60.4 
 
 
250 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  60 
 
 
250 aa  300  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  51.82 
 
 
248 aa  261  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  51.82 
 
 
248 aa  260  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  44.54 
 
 
252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  44.35 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  44.35 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  45.49 
 
 
247 aa  200  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  43.37 
 
 
248 aa  193  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3760  transcriptional regulator, DeoR family  44.1 
 
 
245 aa  180  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0108  transcriptional regulator, DeoR family  41.85 
 
 
236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1728  lactose transport regulator  42.49 
 
 
252 aa  178  7e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 
256 aa  176  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  41.13 
 
 
233 aa  176  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  41.48 
 
 
247 aa  175  6e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
256 aa  159  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  38.57 
 
 
250 aa  155  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0381  transcriptional regulator, DeoR family  38.77 
 
 
229 aa  155  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000667936  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
274 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  39.39 
 
 
258 aa  145  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  36.44 
 
 
257 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0617  DeoR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0340612  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  37.05 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  34.76 
 
 
257 aa  138  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1796  lactose phosphotransferase system repressor  34.55 
 
 
251 aa  138  8.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  33.77 
 
 
254 aa  135  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  35.2 
 
 
248 aa  135  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3257  transcriptional regulator, DeoR family  33.91 
 
 
251 aa  135  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.9425  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0277  transcriptional regulator, DeoR family  34.82 
 
 
245 aa  132  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  35.24 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  33.48 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
288 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  35.14 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2227  DeoR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2266  lactose phosphotransferase system repressor  34.82 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8645  transcriptional regulator, DeoR family  36.36 
 
 
253 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.846335 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6957  DeoR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
268 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
256 aa  128  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1242  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1218  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.46178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1220  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.373784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1343  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1531  DeoR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  36.09 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6298  DeoR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.7128 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1417  transcriptional regulator, DeoR family  32.79 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.381342 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  35.45 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1053  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1442  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0258355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  35.89 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1483  transcriptional regulator, DeoR family  32.79 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.19 
 
 
269 aa  126  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3964  transcriptional regulator, DeoR family  32.23 
 
 
260 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  33.73 
 
 
257 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0635  DeoR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000201895  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  30.99 
 
 
258 aa  125  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  34.63 
 
 
250 aa  125  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
252 aa  125  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
257 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
260 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1243  DeoR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
260 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  35.86 
 
 
252 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  34.4 
 
 
252 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5960  DeoR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
268 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
258 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  31.76 
 
 
267 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  29.72 
 
 
256 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  31.51 
 
 
262 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1380  transcriptional regulator, DeoR family  33.48 
 
 
260 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  34.43 
 
 
264 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
252 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.06 
 
 
269 aa  122  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
261 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
261 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
254 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  32.75 
 
 
249 aa  122  7e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
253 aa  121  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  33.48 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.48 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  33.48 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.48 
 
 
269 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.48 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.48 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  33.48 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.48 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  34.84 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>