More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0590 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
247 aa  489  1e-137  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  46.67 
 
 
250 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  46.09 
 
 
250 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  43.83 
 
 
250 aa  201  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  45.49 
 
 
249 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
250 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  42.98 
 
 
250 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  42.98 
 
 
250 aa  198  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
250 aa  198  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  42.98 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  45.34 
 
 
248 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  44.4 
 
 
248 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0108  transcriptional regulator, DeoR family  42.86 
 
 
236 aa  175  5e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
252 aa  171  9e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
253 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  40.26 
 
 
253 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0381  transcriptional regulator, DeoR family  44.23 
 
 
229 aa  161  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000667936  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  39.06 
 
 
248 aa  150  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  40.76 
 
 
250 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3760  transcriptional regulator, DeoR family  38.89 
 
 
245 aa  144  9e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  37.3 
 
 
247 aa  142  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
256 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  36.96 
 
 
233 aa  143  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
274 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.2 
 
 
258 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  36.16 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0635  DeoR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000201895  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  35.27 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1728  lactose transport regulator  36.8 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  34.18 
 
 
267 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  31.73 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  35.15 
 
 
253 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  34.53 
 
 
254 aa  131  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  31.71 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0277  transcriptional regulator, DeoR family  36.8 
 
 
245 aa  129  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  31.09 
 
 
252 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  36.05 
 
 
257 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  34.74 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
288 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.27 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  34.27 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  31.44 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  34.27 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  32.5 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
253 aa  125  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  31.97 
 
 
266 aa  125  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
254 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  33.48 
 
 
256 aa  125  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
255 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
255 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
255 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0617  DeoR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
244 aa  124  1e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0340612  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  31.73 
 
 
256 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  33.91 
 
 
260 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  31.7 
 
 
253 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  35.4 
 
 
255 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
251 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
248 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  31.15 
 
 
282 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
254 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
254 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
260 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
254 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1034  DeoR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
268 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.631262  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
254 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  34.21 
 
 
254 aa  121  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
267 aa  121  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  33.47 
 
 
256 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl179  fru repressor  35.9 
 
 
230 aa  121  9.999999999999999e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 
266 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  33.48 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4870  DeoR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.69583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2488  transcriptional regulator, DeoR family  30.84 
 
 
265 aa  119  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  29.49 
 
 
266 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2255  DeoR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
256 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2128  DeoR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
256 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  32.58 
 
 
252 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  32 
 
 
268 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5838  DeoR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
256 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  34.5 
 
 
263 aa  119  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2145  DeoR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
256 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0039  transcriptional regulator, DeoR family  34.3 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000112771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
254 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
263 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  31.33 
 
 
275 aa  118  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  32.13 
 
 
253 aa  118  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>