More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0995 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
264 aa  514  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  49.43 
 
 
282 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  48.31 
 
 
263 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  48.85 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  48.68 
 
 
266 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  47.39 
 
 
263 aa  192  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  45.74 
 
 
267 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  48.06 
 
 
289 aa  188  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3971  transcriptional regulator, DeoR family  48.66 
 
 
262 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.229273  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2958  transcriptional regulator, DeoR family  46.21 
 
 
262 aa  175  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00162277  decreased coverage  0.000126005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  46.61 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  47.17 
 
 
260 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0542275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2488  transcriptional regulator, DeoR family  48.47 
 
 
265 aa  168  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  44.92 
 
 
290 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
254 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  41.3 
 
 
266 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  41.25 
 
 
256 aa  142  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  38.68 
 
 
253 aa  140  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  42.27 
 
 
248 aa  138  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  36.08 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  37.88 
 
 
267 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32750  transcriptional regulator, DeoR family  39.53 
 
 
261 aa  135  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19583  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  34.02 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  41.15 
 
 
253 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  36.74 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  32.3 
 
 
258 aa  132  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
250 aa  132  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  30.83 
 
 
258 aa  132  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  41.87 
 
 
253 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  37.3 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0975  LacR family lactose transport regulator  37.24 
 
 
237 aa  128  9.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  34.87 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  34.39 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.05 
 
 
258 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  33.86 
 
 
254 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  33.21 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  36 
 
 
258 aa  125  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
256 aa  125  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
260 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  37.76 
 
 
254 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  39.53 
 
 
254 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
248 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  39.84 
 
 
253 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
267 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  37.18 
 
 
248 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  34.73 
 
 
258 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
258 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  34.73 
 
 
258 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8645  transcriptional regulator, DeoR family  38.02 
 
 
253 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.846335 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
249 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  38.27 
 
 
253 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  31.62 
 
 
249 aa  122  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
288 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  33.98 
 
 
254 aa  122  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
256 aa  122  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 
253 aa  122  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
254 aa  122  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  37.45 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  31.82 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  31.64 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  38.71 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
266 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  39.22 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  34.6 
 
 
257 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  34.6 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  34.6 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  34.6 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  41.06 
 
 
253 aa  118  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  34.44 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  38.33 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  34.6 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  31.03 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  34.41 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2802  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.364979  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  34.41 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  34.41 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  33.76 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1796  lactose phosphotransferase system repressor  31.52 
 
 
251 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  30.3 
 
 
254 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  33.07 
 
 
255 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.13 
 
 
269 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 
250 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
255 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2227  DeoR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2266  lactose phosphotransferase system repressor  34.76 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
255 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
255 aa  116  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  33.76 
 
 
250 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>