More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2488 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2488  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
265 aa  503  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  52.65 
 
 
266 aa  228  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  53.9 
 
 
266 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  53.03 
 
 
289 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  49.23 
 
 
282 aa  219  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  51.74 
 
 
267 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  52.31 
 
 
260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0542275 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  49.45 
 
 
267 aa  211  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  52.44 
 
 
290 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  49.43 
 
 
263 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
263 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3971  transcriptional regulator, DeoR family  56.34 
 
 
262 aa  203  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.229273  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2958  transcriptional regulator, DeoR family  53.82 
 
 
262 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00162277  decreased coverage  0.000126005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  45.95 
 
 
264 aa  175  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  43.28 
 
 
266 aa  168  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32750  transcriptional regulator, DeoR family  45.77 
 
 
261 aa  162  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19583  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
258 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0975  LacR family lactose transport regulator  40.87 
 
 
237 aa  157  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  40.42 
 
 
260 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 
250 aa  149  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3470  transcriptional regulator, DeoR family  46.04 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
256 aa  145  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.05 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
274 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
267 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  39.92 
 
 
253 aa  135  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  43.44 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  38.4 
 
 
253 aa  132  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  40.93 
 
 
253 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  35.71 
 
 
267 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  30.25 
 
 
252 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.16 
 
 
269 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  32.16 
 
 
269 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  32.16 
 
 
269 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.16 
 
 
269 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.16 
 
 
269 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.16 
 
 
269 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.16 
 
 
269 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  38.66 
 
 
248 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
253 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  34.66 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  39.34 
 
 
253 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  27.53 
 
 
249 aa  126  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
253 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.17 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.05 
 
 
269 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  31.98 
 
 
254 aa  125  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  33.62 
 
 
247 aa  124  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 
247 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  33.59 
 
 
258 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  36.72 
 
 
253 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  36.65 
 
 
262 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  39 
 
 
253 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
251 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  26.29 
 
 
252 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  26.94 
 
 
252 aa  123  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
288 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3258  DeoR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
251 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000943791  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  38.27 
 
 
256 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  38.66 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  29.88 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  29.7 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  37.2 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  34.31 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  31.69 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.63 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  28.24 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  40.3 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
255 aa  119  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  37.84 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.91 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  32.27 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2227  DeoR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2266  lactose phosphotransferase system repressor  32.91 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
250 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  32.27 
 
 
250 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  28.9 
 
 
257 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  32.67 
 
 
250 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  34.11 
 
 
258 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  36.51 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  32.8 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2486  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.382458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2786  transcriptional regulator, DeoR family  41.15 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2619  DeoR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1144  DeoR family transcriptional regulator  35.95 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>