More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7919 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 267 aa  527  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  68.22 
 
 		 263 aa  331  9e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  61.81 
 
 		 266 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  61.74 
 
 		 266 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  55.81 
 
 		 282 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  59.38 
 
 		 290 aa  287  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  57.59 
 
 		 289 aa  275  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  58.66 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0542275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32750  transcriptional regulator, DeoR family  54.17 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  50.94 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3971  transcriptional regulator, DeoR family  53.93 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.229273  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2958  transcriptional regulator, DeoR family  51.74 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00162277  decreased coverage  0.000126005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2488  transcriptional regulator, DeoR family  51.74 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  45.74 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3470  transcriptional regulator, DeoR family  47.26 
 
 		 266 aa  175  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0975  LacR family lactose transport regulator  40.53 
 
 		 237 aa  169  5e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  41.1 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.82 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  41.77 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  29.84 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  32.38 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  38.08 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  39.34 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  36.6 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  29.25 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  35.89 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  41.55 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.89 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  31.89 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  39.26 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.89 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  37.2 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.89 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.89 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.89 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  31.89 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  35.44 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 258 aa  131  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.1 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.5 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.89 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1357  transcriptional regulator, DeoR family  38.58 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403585 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  31.37 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  35.1 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  30.98 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06583  hypothetical protein  34.19 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  31.91 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  41.77 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2172  DeoR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  35 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.4 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 251 aa  126  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  37.21 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3258  DeoR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000943791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  38.02 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000701  putative regulatory protein  33.48 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.456965  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  35.35 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  35.35 
 
 		 278 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0889  DeoR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 348 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  28.46 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 250 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  32.19 
 
 		 250 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  38.52 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  35.14 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  34.45 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  35.14 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 251 aa  122  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  38.56 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.75 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  35.71 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  31.85 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  34.75 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2227  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2266  lactose phosphotransferase system repressor  33.33 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>