More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2141 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 253 aa  490  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  73.12 
 
 		 253 aa  374  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  69.84 
 
 		 253 aa  352  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  69.96 
 
 		 253 aa  348  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  71.15 
 
 		 253 aa  341  5e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  64.8 
 
 		 253 aa  319  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  57.31 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  60.08 
 
 		 253 aa  281  7.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  58.1 
 
 		 253 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  56.52 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  56.71 
 
 		 253 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  58.89 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 259 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  49.8 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 255 aa  215  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  45.85 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  47.66 
 
 		 256 aa  205  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 269 aa  190  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  41.79 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  45.7 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  39.44 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  34 
 
 		 253 aa  156  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  38.65 
 
 		 267 aa  152  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  35.63 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  39.66 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  30.86 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  32.81 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  35.77 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  37.93 
 
 		 257 aa  144  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  41.49 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  40.86 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  36.18 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  40.8 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  34.39 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  33.86 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  39.22 
 
 		 266 aa  138  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1218  regulatory protein DeoR  47.31 
 
 		 205 aa  138  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658243  decreased coverage  0.00388066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  32.11 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  35.69 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  40.74 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  37.05 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  36.97 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  33.86 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.13 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.13 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 253 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  42.46 
 
 		 266 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 258 aa  135  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  33.86 
 
 		 257 aa  135  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  36.52 
 
 		 233 aa  135  9e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  34.13 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  34.13 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  34.13 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.13 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.13 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  39.38 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.13 
 
 		 269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.73 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  35.8 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  38.79 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.95 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  41.06 
 
 		 264 aa  131  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.73 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  35.61 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  38.25 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  34.85 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  37.2 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  32.4 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.6 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>