More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2500 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 253 aa  494  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  83.33 
 
 		 253 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  73.41 
 
 		 253 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  69.84 
 
 		 253 aa  328  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  65.74 
 
 		 253 aa  321  7e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  66.27 
 
 		 253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  58.73 
 
 		 253 aa  281  8.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  57.77 
 
 		 253 aa  274  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  55.16 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  58.73 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  58.01 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  55.56 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  46.43 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  47.04 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  46.85 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 269 aa  184  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  49.36 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  41.73 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  37.85 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 274 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 254 aa  151  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  39.41 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  31.87 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  36.59 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 256 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 264 aa  138  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  34 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  40.16 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 264 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 		 253 aa  135  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  35.18 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  41.15 
 
 		 264 aa  135  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  39 
 
 		 282 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 258 aa  134  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  41.12 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  29.67 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  32.79 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  36.76 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  37.05 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2534  DeoR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000015777  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1218  regulatory protein DeoR  43.58 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658243  decreased coverage  0.00388066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 284 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  32.37 
 
 		 248 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  35.37 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  32.41 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  35.43 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  37.13 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  38.46 
 
 		 266 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  36.21 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  34.33 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.44 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  37.66 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  30.83 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  38.27 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2567  DeoR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  38.55 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  36 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  29.55 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2517  transcriptional regulator, DeoR family  30.98 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0400027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  34.89 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2819  transcriptional regulator, DeoR family  30.98 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0209675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  39.17 
 
 		 289 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.28 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.13 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.28 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  32.28 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.28 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>