More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0146 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
250 aa  504  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  76 
 
 
256 aa  362  4e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  50.2 
 
 
274 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
258 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  43.43 
 
 
257 aa  206  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  44.16 
 
 
260 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  43.03 
 
 
267 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  42.74 
 
 
264 aa  185  8e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  41.83 
 
 
253 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  39.36 
 
 
256 aa  180  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
288 aa  175  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  42.79 
 
 
260 aa  175  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.99 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  42.37 
 
 
254 aa  171  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  38.1 
 
 
254 aa  171  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  39.91 
 
 
261 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  38.53 
 
 
248 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  41.56 
 
 
257 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  38 
 
 
253 aa  168  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  43.53 
 
 
264 aa  168  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
251 aa  168  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
256 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  39.83 
 
 
253 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  37.15 
 
 
255 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  37.15 
 
 
255 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  37.15 
 
 
255 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  40.93 
 
 
255 aa  166  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  36.59 
 
 
254 aa  166  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  39.22 
 
 
253 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
260 aa  166  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  39.02 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
253 aa  165  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  38.34 
 
 
259 aa  165  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  39.53 
 
 
259 aa  164  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  39.13 
 
 
257 aa  162  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
257 aa  162  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  39.13 
 
 
257 aa  162  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  39.13 
 
 
257 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  39.13 
 
 
259 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  39.04 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  39.47 
 
 
258 aa  162  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  36.71 
 
 
258 aa  162  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
253 aa  161  9e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  35.86 
 
 
257 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  38.4 
 
 
267 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
242 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
259 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 
253 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  37.85 
 
 
253 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0039  transcriptional regulator, DeoR family  39.43 
 
 
247 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000112771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
250 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  36.8 
 
 
252 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  38.89 
 
 
250 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
250 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  38.46 
 
 
250 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  37.34 
 
 
257 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
250 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
250 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  36.65 
 
 
254 aa  158  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  38.03 
 
 
250 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
250 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 
252 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
265 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
250 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  35.04 
 
 
275 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  42.11 
 
 
248 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  34.57 
 
 
262 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  38.03 
 
 
250 aa  156  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
260 aa  155  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
249 aa  155  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  38.65 
 
 
253 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  36.02 
 
 
253 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  36.4 
 
 
250 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
252 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
258 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  37.21 
 
 
263 aa  155  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  36.84 
 
 
258 aa  155  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  36.84 
 
 
258 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  36.86 
 
 
254 aa  154  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  36.75 
 
 
266 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
255 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  35.68 
 
 
261 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  35.86 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  36.96 
 
 
269 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  37.39 
 
 
276 aa  152  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  36.11 
 
 
263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
258 aa  152  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  40 
 
 
248 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  39.44 
 
 
253 aa  151  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  37.3 
 
 
257 aa  151  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4020  transcriptional regulator, DeoR family  37.97 
 
 
255 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  38.82 
 
 
254 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>