More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2850 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 262 aa  521  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2456  DeoR family transcriptional regulator  45 
 
 		 262 aa  175  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2986  DeoR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247134  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  34.57 
 
 		 250 aa  156  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  39.37 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  41.53 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  38.06 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  38.74 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  38.43 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  38.37 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  38.49 
 
 		 248 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  36.99 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0242  transcriptional regulator, DeoR family  36.94 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  35.63 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  39.68 
 
 		 289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  34.23 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  38.14 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  37.02 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  36.89 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  36.95 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  36.21 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  32.92 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  31.78 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  34.45 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3971  transcriptional regulator, DeoR family  40.17 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.229273  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  36.75 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.02 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  35.17 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  35.17 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  41.41 
 
 		 253 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  38.59 
 
 		 267 aa  128  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  38.59 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0561  transcriptional regulator, DeoR family  37.14 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.725961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.84 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  40.77 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  31.44 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32750  transcriptional regulator, DeoR family  38.31 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19583  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  31.88 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 257 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0542275 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2486  transcriptional regulator, DeoR family  36.68 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.382458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8645  transcriptional regulator, DeoR family  37.28 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.846335 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  31.88 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  33.87 
 
 		 257 aa  125  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0882  transcriptional regulator, DeoR family  35.9 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.262564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  31.44 
 
 		 250 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  34.13 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  33.33 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3321  DeoR family transcriptional regulator  37 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  33.33 
 
 		 258 aa  123  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  33.85 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  35.47 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  36.25 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.41 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8240  transcriptional regulator protein  36.53 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.647989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2643  DeoR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00470761  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  36.14 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  33.76 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3725  transcriptional regulator, DeoR family  30.89 
 
 		 276 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3397  DeoR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3264  DeoR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  31.89 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  30.45 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>