More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0975 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0975  LacR family lactose transport regulator  100 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  40.53 
 
 		 267 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  41.53 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  39.83 
 
 		 263 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  39.66 
 
 		 290 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  38.6 
 
 		 282 aa  158  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  39.47 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  40.43 
 
 		 260 aa  154  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0542275 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  39.91 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2958  transcriptional regulator, DeoR family  41.31 
 
 		 262 aa  141  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00162277  decreased coverage  0.000126005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  35.53 
 
 		 289 aa  138  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2488  transcriptional regulator, DeoR family  40.5 
 
 		 265 aa  138  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 274 aa  136  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 258 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3971  transcriptional regulator, DeoR family  39.21 
 
 		 262 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.229273  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  37.2 
 
 		 266 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  34.88 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  37.24 
 
 		 264 aa  128  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  32.55 
 
 		 267 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  35.43 
 
 		 250 aa  121  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32750  transcriptional regulator, DeoR family  34.18 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.14 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  32.11 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  34.7 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  30.73 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  35.61 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.75 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  35.27 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  32.14 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  35.24 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  32.47 
 
 		 264 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.41 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  34.91 
 
 		 253 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.94 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  30 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3571  DeoR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6265  transcriptional regulator DeoR family  33.64 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 253 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  32.11 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  32.55 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.13 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  30.13 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.13 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  30.13 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.13 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.13 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.13 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01920  transcriptional regulator of sugar metabolism  33.33 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  33.01 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  28.77 
 
 		 252 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6709  transcriptional regulator, DeoR family  32.19 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902582  normal  0.293598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  34.96 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  30.37 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.26 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  29.82 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  33.64 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5808  transcriptional regulator, DeoR family  32.62 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.0818645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4814  transcriptional regulator, DeoR family  33.8 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  28.33 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  28.33 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  29.13 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  33.48 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  34.3 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3258  DeoR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000943791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  34.27 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.18 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2786  transcriptional regulator, DeoR family  36.15 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  33.18 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  33.18 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  27.93 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  30.67 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2435  transcriptional regulator  33.48 
 
 		 284 aa  99.8  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  29.36 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  28.38 
 
 		 250 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>