More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2786 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2786  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
268 aa  518  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1851  regulatory protein, DeoR  60.15 
 
 
264 aa  288  6e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  42.74 
 
 
257 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
254 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  35.46 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  44.87 
 
 
256 aa  145  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 
250 aa  143  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.84 
 
 
265 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  36.84 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2488  transcriptional regulator, DeoR family  44.04 
 
 
265 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
274 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  36.84 
 
 
265 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  37.66 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  33.62 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  39.83 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  36.4 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
263 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  37.28 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  37.28 
 
 
254 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
254 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
254 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  40.32 
 
 
266 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  33.48 
 
 
255 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
256 aa  136  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  37.66 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  39.6 
 
 
262 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  34.51 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  38.56 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.21 
 
 
269 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  35.39 
 
 
264 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  35.41 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  32.06 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
258 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  36.25 
 
 
253 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  30.12 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
266 aa  128  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 
267 aa  128  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  38.52 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  30.52 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  35.77 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  43.6 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  40.16 
 
 
289 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.27 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  38.07 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  37.4 
 
 
254 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
249 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.23 
 
 
269 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  37.32 
 
 
254 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0975  LacR family lactose transport regulator  37.74 
 
 
237 aa  123  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.23 
 
 
269 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  31.23 
 
 
269 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.23 
 
 
269 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
288 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.23 
 
 
269 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.23 
 
 
269 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  31.23 
 
 
269 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  31.73 
 
 
255 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2578  DeoR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
256 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000422866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2765  DeoR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
256 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2772  transcriptional regulator, DeoR family  31.66 
 
 
256 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0124303 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  36.08 
 
 
256 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  36.75 
 
 
267 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.37 
 
 
269 aa  122  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  38.46 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  35.74 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  32.48 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.25 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2798  DeoR family transcriptional regulator  31.27 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0120141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2498  DeoR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0137316  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  32.05 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  34.94 
 
 
258 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  34.43 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  32.64 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  34.43 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2567  DeoR family transcriptional regulator  32.55 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  34.13 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  40.77 
 
 
256 aa  119  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  34.93 
 
 
252 aa  119  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  35.62 
 
 
254 aa  119  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2534  DeoR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
256 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000015777  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
261 aa  118  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
261 aa  118  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  32.39 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  32.89 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>