More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3108 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  99.21 
 
 		 254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  98.82 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  98.82 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  98.43 
 
 		 254 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  85.43 
 
 		 265 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  85.43 
 
 		 255 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  85.83 
 
 		 255 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  85.83 
 
 		 255 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  85.43 
 
 		 265 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  85.43 
 
 		 255 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  85.43 
 
 		 255 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  66 
 
 		 254 aa  339  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  60.71 
 
 		 252 aa  321  6e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  60.32 
 
 		 253 aa  320  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2128  DeoR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 256 aa  315  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2255  DeoR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 256 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2145  DeoR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 256 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 263 aa  258  9e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 263 aa  258  9e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0011  sugar metabolism transcriptional regulator  48.21 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2548  DeoR family transcriptional regulator  51.38 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992878 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0103  HTH-type transcriptional regulator, DeoR-family  47.6 
 
 		 251 aa  241  6e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04749  transcriptional regulator  48.42 
 
 		 221 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0907  DeoR family transcriptional regulator  45.2 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0778  transcriptional regulator, DeoR family  45.2 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2824  DeoR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1460  DeoR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585922  normal  0.541781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2746  DeoR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.437292  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0362  transcriptional regulator, DeoR family  42.29 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4814  regulatory protein, DeoR  42.29 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2335  transcriptional regulator, DeoR family  41.6 
 
 		 268 aa  185  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0880169  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3732  transcriptional regulator, DeoR family  41.5 
 
 		 283 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  37.18 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  37.99 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  36.28 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  37.4 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  35.78 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0693  transcriptional regulator, DeoR family  36.24 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0188  DeoR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0179  DeoR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0196  DeoR-family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.841984  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0183  DeoR-family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.341023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0180  DeoR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 274 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  37.1 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  34.47 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  34.47 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  34.3 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.48 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  29.48 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  29.48 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.48 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.48 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.48 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.48 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  34.96 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  30.68 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.48 
 
 		 269 aa  125  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  29.25 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  33.8 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 264 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  34.15 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.13 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.53 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  30.12 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  35.51 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 266 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  31.76 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  33.77 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4361  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.14783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  35.14 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 263 aa  121  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  30.49 
 
 		 258 aa  121  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4503  DeoR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259499  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.14 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  29.48 
 
 		 258 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  29.48 
 
 		 258 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 258 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3952  DeoR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00923928  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  29.88 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  31.52 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4306  transcriptional regulator, DeoR family  30.92 
 
 		 257 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121893 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  31.52 
 
 		 257 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>