More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3507 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  100 
 
 
254 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  70.12 
 
 
255 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  52.57 
 
 
254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  53.75 
 
 
256 aa  275  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  46.85 
 
 
254 aa  224  9e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  42.13 
 
 
252 aa  192  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  38.58 
 
 
258 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
288 aa  161  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
267 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
257 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
256 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.65 
 
 
269 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
261 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
261 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
254 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.69 
 
 
269 aa  155  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
261 aa  155  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
260 aa  155  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  35.86 
 
 
269 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  35.86 
 
 
269 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.86 
 
 
269 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
258 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.86 
 
 
269 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  36.22 
 
 
258 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  35.86 
 
 
269 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.86 
 
 
269 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  36.22 
 
 
258 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.46 
 
 
269 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
260 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.86 
 
 
269 aa  152  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  32.13 
 
 
253 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  36.14 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  36.14 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  35.74 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  35.74 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.74 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  35.74 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.74 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.34 
 
 
257 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.74 
 
 
257 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.74 
 
 
257 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.74 
 
 
257 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.74 
 
 
257 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.74 
 
 
257 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.74 
 
 
257 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  31.2 
 
 
258 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  34.26 
 
 
258 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
261 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  34 
 
 
252 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  32.41 
 
 
256 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.93 
 
 
257 aa  142  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  31.75 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  31.33 
 
 
253 aa  138  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
258 aa  138  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
253 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  32.53 
 
 
254 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
255 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  35.22 
 
 
250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  32.54 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  33.73 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.87 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  30.68 
 
 
255 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6212  transcriptional regulator, DeoR family  31.91 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  0.761019 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  31.58 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
284 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  32.33 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1357  transcriptional regulator, DeoR family  31.92 
 
 
263 aa  129  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  31.33 
 
 
253 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  32.53 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  32.3 
 
 
257 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  31.3 
 
 
253 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  30.35 
 
 
261 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
266 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01920  transcriptional regulator of sugar metabolism  29.18 
 
 
261 aa  126  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  31.73 
 
 
248 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3840  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
256 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.897226  hitchhiker  0.000196031 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  30.08 
 
 
253 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  31.23 
 
 
278 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  32.3 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  32.3 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  32.3 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0673  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.15 
 
 
269 aa  125  5e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4041  transcriptional regulator, DeoR family protein  35.02 
 
 
256 aa  125  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112055  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  28.4 
 
 
253 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
252 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
264 aa  125  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  31.91 
 
 
257 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
261 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  32.02 
 
 
266 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  29.89 
 
 
261 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  29.55 
 
 
253 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  29.54 
 
 
260 aa  123  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  29.84 
 
 
263 aa  123  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0183  DeoR-family transcriptional regulator  31.43 
 
 
255 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.341023  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  30.12 
 
 
268 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
265 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>