More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3023 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  100 
 
 
257 aa  530  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  100 
 
 
257 aa  530  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  100 
 
 
257 aa  530  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  100 
 
 
257 aa  530  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  99.61 
 
 
257 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  94.55 
 
 
257 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  94.55 
 
 
257 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  94.55 
 
 
257 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  94.55 
 
 
257 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  94.94 
 
 
257 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  94.94 
 
 
257 aa  505  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  94.55 
 
 
257 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  94.16 
 
 
257 aa  502  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  94.16 
 
 
257 aa  500  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  70.82 
 
 
257 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0673  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  50.93 
 
 
269 aa  271  9e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3949  chitinase II  46.22 
 
 
255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.985635  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5197  DeoR family transcriptional regulator  44.4 
 
 
258 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.342459  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5727  DeoR family transcriptional regulator  45.67 
 
 
258 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1537  DeoR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
260 aa  207  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000092764  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5428  DeoR family transcriptional regulator  43.63 
 
 
258 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5410  DeoR family transcriptional regulator  43.63 
 
 
258 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.378654  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5292  DeoR family transcriptional regulator  43.63 
 
 
258 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0038  DeoR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
260 aa  202  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3840  DeoR family transcriptional regulator  43.15 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.897226  hitchhiker  0.000196031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5596  transcriptional regulator, DeoR family  43.03 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2823  putative glucitol operon repressor  42.46 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00830  transcriptional regulator  42.74 
 
 
253 aa  199  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4603  DeoR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
256 aa  199  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4742  DeoR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5118  regulatory protein, DeoR  42.06 
 
 
255 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3921  DeoR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230254  normal  0.0231627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4013  DeoR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0489456  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4041  transcriptional regulator, DeoR family protein  41.94 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4126  DeoR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.138481  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3952  DeoR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
256 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00923928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4503  DeoR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259499  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001644  transcriptional regulator of GlmS, DeoR family  43.15 
 
 
253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00296274  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4361  DeoR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
256 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.14783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73190  GlmR transcriptional regulator  43.5 
 
 
257 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6351  GlmR transcriptional regulator  43.5 
 
 
257 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4943  DeoR family transcriptional regulator  41.37 
 
 
254 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4482  DeoR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
256 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000793967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51900  transcriptional regualtory protein, GlmR, DeoR family  43.55 
 
 
254 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3640  DeoR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
254 aa  192  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000875661  normal  0.0587725 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3281  DeoR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
256 aa  192  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4306  transcriptional regulator, DeoR family  40.55 
 
 
257 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000121893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4362  DeoR family transcriptional regulator  40.55 
 
 
257 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0187642  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4893  DeoR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
256 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4235  DeoR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
268 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00275113  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3744  regulatory protein, DeoR  42.17 
 
 
256 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  42.63 
 
 
256 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
257 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  35.83 
 
 
269 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  35.83 
 
 
269 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  35.83 
 
 
269 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.83 
 
 
269 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.83 
 
 
269 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.83 
 
 
269 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.83 
 
 
269 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.83 
 
 
269 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.86 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  37.35 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  37.35 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3880  DeoR family transcriptional regulator  38.87 
 
 
276 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.46923  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
261 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  39.22 
 
 
258 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03885  transcriptional regulator, DeoR family protein  37.13 
 
 
269 aa  169  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.81593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
260 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  37.85 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  39.45 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  39.45 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  39.45 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  39.45 
 
 
259 aa  165  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  39.45 
 
 
259 aa  165  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.25 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  37.35 
 
 
257 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  37.35 
 
 
257 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  37.35 
 
 
257 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  37.35 
 
 
257 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  37.35 
 
 
257 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
267 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  36 
 
 
254 aa  155  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  33.33 
 
 
263 aa  148  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  35.94 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  33.59 
 
 
255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  38.55 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  37.11 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  34.39 
 
 
257 aa  145  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  37.85 
 
 
267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.11 
 
 
250 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  35.74 
 
 
254 aa  145  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
264 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
254 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  36.36 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>