More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0893 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  61.98 
 
 
256 aa  325  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6212  transcriptional regulator, DeoR family  57.47 
 
 
261 aa  302  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  0.761019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  59.77 
 
 
261 aa  291  8e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  59 
 
 
261 aa  288  8e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  57.47 
 
 
261 aa  275  8e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16690  transcriptional regulator, DeoR family  57.31 
 
 
261 aa  244  6.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1357  transcriptional regulator, DeoR family  46.56 
 
 
263 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01920  transcriptional regulator of sugar metabolism  47.77 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  47.51 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  46.54 
 
 
254 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  46.12 
 
 
252 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  45.82 
 
 
258 aa  188  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24390  transcriptional regulator of sugar metabolism  41.38 
 
 
284 aa  180  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0280165  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2435  transcriptional regulator, DeoR family  42.31 
 
 
253 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0079946  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  40.47 
 
 
278 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
284 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
261 aa  148  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
261 aa  148  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
261 aa  146  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  31.27 
 
 
254 aa  145  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  32.82 
 
 
255 aa  142  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  33.33 
 
 
254 aa  142  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  37.4 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
260 aa  139  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.88 
 
 
258 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
260 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  30.86 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  36.48 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
257 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  32.03 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  32.03 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
256 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  38.14 
 
 
264 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  33.59 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  36.67 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  39.51 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  30.62 
 
 
252 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  30.62 
 
 
252 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.62 
 
 
252 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.62 
 
 
252 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.62 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.62 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.62 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.62 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  30.62 
 
 
252 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  33.59 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  31.03 
 
 
258 aa  128  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02920  transcriptional regulator of sugar metabolism  34.87 
 
 
276 aa  128  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  39.13 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
277 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.84 
 
 
252 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.84 
 
 
252 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.84 
 
 
252 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  36.44 
 
 
260 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.84 
 
 
252 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  30.12 
 
 
257 aa  124  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.79 
 
 
251 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.79 
 
 
251 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
274 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3731  regulatory protein, DeoR  34.31 
 
 
254 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.74 
 
 
252 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  32.42 
 
 
256 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  34.63 
 
 
256 aa  122  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  29.07 
 
 
252 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3044  glycerol-3-phosphate regulon repressor transcription regulator protein  32.4 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453979  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0380  transcriptional regulator, DeoR family  30.52 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
254 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  32.51 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.33 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  29.69 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.33 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.33 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.33 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.33 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
294 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  32.2 
 
 
257 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  34.12 
 
 
254 aa  118  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.33 
 
 
278 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.33 
 
 
278 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.13 
 
 
278 aa  118  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  32.2 
 
 
257 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>