More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0248 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  518  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  98.47 
 
 		 261 aa  511  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6212  transcriptional regulator, DeoR family  69.73 
 
 		 261 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  0.761019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  61.3 
 
 		 256 aa  324  8.000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  59 
 
 		 261 aa  305  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  58.24 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16690  transcriptional regulator, DeoR family  55.98 
 
 		 261 aa  241  6e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01920  transcriptional regulator of sugar metabolism  46.92 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1357  transcriptional regulator, DeoR family  47.13 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403585 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  50.19 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  44.27 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  44.96 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  43.89 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24390  transcriptional regulator of sugar metabolism  41.11 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0280165  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 261 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 261 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  40.94 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2435  transcriptional regulator, DeoR family  42.37 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0079946  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  39.3 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  34.75 
 
 		 250 aa  148  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  35.97 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  31.89 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 266 aa  141  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.5 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  37.02 
 
 		 264 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  39.74 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  29.57 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  33.85 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  33.85 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  29.96 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  29.18 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 257 aa  131  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  31.52 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02920  transcriptional regulator of sugar metabolism  35.85 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  36.6 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  33.46 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  29.8 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  36.4 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  34.75 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  38.8 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.35 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  31.25 
 
 		 254 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.35 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.35 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.35 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  28.74 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.35 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 274 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  34.87 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.74 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  28.74 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.74 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.74 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.35 
 
 		 269 aa  123  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.74 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.74 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.74 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  38.8 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  32.16 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.74 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.74 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  28.74 
 
 		 252 aa  122  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  30.74 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.74 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  30.74 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.74 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.74 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  35.25 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  32.23 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  32.23 
 
 		 252 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0380  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  32.77 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  31.82 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  31.82 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  34.09 
 
 		 268 aa  118  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  31.84 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  35.17 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1034  DeoR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.631262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>