More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1535 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 253 aa  481  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  64.03 
 
 		 253 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  63.24 
 
 		 253 aa  308  5.9999999999999995e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  60.4 
 
 		 253 aa  281  7.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  63.24 
 
 		 253 aa  278  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  58.89 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  59.68 
 
 		 253 aa  268  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  58.73 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  56.52 
 
 		 253 aa  265  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  60.08 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  59.29 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  54.94 
 
 		 253 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  48.22 
 
 		 255 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  51.71 
 
 		 259 aa  205  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  46.46 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  44.53 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  47.03 
 
 		 256 aa  181  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  42.86 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  34.4 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  41.49 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  43.22 
 
 		 282 aa  155  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.02 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  32.13 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  39.33 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  36.55 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  39.11 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  34.27 
 
 		 254 aa  148  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  36.4 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  36.4 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  36.4 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  31.71 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  36.4 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  30.83 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  34.4 
 
 		 253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  37.4 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  39.57 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  40.52 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 267 aa  141  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3258  DeoR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000943791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  35.97 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  40.32 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  39.41 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 231 aa  138  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  35.43 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  40.1 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.55 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  35.9 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  34.31 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  36.86 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  34.31 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  34.31 
 
 		 250 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  35.86 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 250 aa  135  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  35.86 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  35.86 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  35.86 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.24 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  38.06 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  41.31 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 250 aa  135  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.06 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 258 aa  135  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 254 aa  135  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 266 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  36.21 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>