More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0941 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
251 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
251 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  98.8 
 
 
251 aa  480  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  96.81 
 
 
251 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  94.02 
 
 
251 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  80.88 
 
 
267 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  72.51 
 
 
251 aa  340  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  68.13 
 
 
251 aa  330  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  64.8 
 
 
253 aa  318  7.999999999999999e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  68.92 
 
 
251 aa  316  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  62.95 
 
 
251 aa  279  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  60.56 
 
 
254 aa  278  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  50.4 
 
 
251 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  50.4 
 
 
252 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  52.92 
 
 
251 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  51.6 
 
 
252 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  53.41 
 
 
250 aa  218  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  47.81 
 
 
251 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  38.96 
 
 
248 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  39.45 
 
 
249 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  36.86 
 
 
261 aa  174  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  41.94 
 
 
261 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
254 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  40.16 
 
 
258 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  40.09 
 
 
261 aa  158  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
256 aa  158  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  39.27 
 
 
258 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  35.48 
 
 
253 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
231 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  37.94 
 
 
253 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  32.52 
 
 
249 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  36.95 
 
 
248 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  35.53 
 
 
259 aa  148  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  36.72 
 
 
253 aa  148  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  33.33 
 
 
249 aa  148  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  37.94 
 
 
253 aa  148  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  35.65 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  33.33 
 
 
248 aa  145  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  34.58 
 
 
248 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
286 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
260 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
260 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  36.99 
 
 
249 aa  142  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  39.27 
 
 
253 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  40 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  34.51 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  36.04 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  38.25 
 
 
257 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
260 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  33.02 
 
 
257 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
270 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  39.75 
 
 
315 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  39.75 
 
 
376 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  35.43 
 
 
258 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  33.75 
 
 
249 aa  136  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  30.4 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  36 
 
 
258 aa  135  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
260 aa  135  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
253 aa  135  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  31.74 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  35.16 
 
 
253 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
265 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
257 aa  132  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
274 aa  132  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  35.04 
 
 
253 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  36.36 
 
 
247 aa  129  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  38.14 
 
 
255 aa  125  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  35.21 
 
 
268 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.6 
 
 
252 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.6 
 
 
252 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.6 
 
 
252 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8218  transcriptional regulator, DeoR family  39.51 
 
 
263 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437389  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.6 
 
 
252 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.6 
 
 
252 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.6 
 
 
252 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
253 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  31.6 
 
 
252 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  33.59 
 
 
253 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  31.6 
 
 
252 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.03 
 
 
252 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.03 
 
 
252 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.03 
 
 
252 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.03 
 
 
252 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.03 
 
 
252 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 
252 aa  121  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  30.51 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>