More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2259 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  494  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  72.51 
 
 		 251 aa  358  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  72.51 
 
 		 251 aa  358  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  72.11 
 
 		 251 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  71.31 
 
 		 251 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  70.92 
 
 		 251 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  71.31 
 
 		 267 aa  352  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  67.6 
 
 		 253 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  64.94 
 
 		 251 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  66.53 
 
 		 251 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  67.73 
 
 		 251 aa  307  9e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  59.76 
 
 		 254 aa  275  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  52.78 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  50.81 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  52.08 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  50.6 
 
 		 250 aa  224  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  46.99 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  46.61 
 
 		 251 aa  218  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  40.83 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  38.96 
 
 		 248 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  40.32 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  37 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  34.02 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  33.06 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  33.06 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  33.91 
 
 		 249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  35.65 
 
 		 248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  34.54 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  35.83 
 
 		 248 aa  151  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  38.06 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  35.16 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  35.63 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  33.99 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  35.57 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  35.34 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 286 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  35.65 
 
 		 247 aa  141  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 274 aa  141  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  33.2 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  35.05 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 315 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  34 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  34.38 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 376 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  35.77 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  35.69 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  34.86 
 
 		 249 aa  135  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  31.89 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  29.64 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.71 
 
 		 269 aa  131  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.1 
 
 		 269 aa  131  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  31.89 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  37.22 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  36.11 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.87 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.87 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.87 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  31.87 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  31.87 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.87 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.87 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.87 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 		 268 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  28.74 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.81 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  34.39 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  35.55 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  32.17 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 270 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 269 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 255 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  32.16 
 
 		 253 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  37.7 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>