More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4070 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  533  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  92.86 
 
 		 284 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1360  DeoR family transcriptional regulator  88.26 
 
 		 274 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.019749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  87.97 
 
 		 265 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  83.27 
 
 		 277 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  68.53 
 
 		 260 aa  347  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3729  transcriptional regulator, DeoR family  66.15 
 
 		 267 aa  343  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  63.05 
 
 		 254 aa  325  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  63.35 
 
 		 256 aa  323  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  64 
 
 		 256 aa  322  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0199  glycerol-3-phosphate transcriptional regulator  62.25 
 
 		 263 aa  318  5e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464707  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  61.85 
 
 		 257 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  61.45 
 
 		 257 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0191  glycerol-3-phosphate regulon repressor  62.25 
 
 		 314 aa  317  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.276628  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  62.25 
 
 		 263 aa  315  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3270  DeoR family transcriptional regulator  63.86 
 
 		 253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  50.6 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  53.56 
 
 		 261 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 259 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  51.21 
 
 		 294 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  51.21 
 
 		 259 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 253 aa  245  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  50.41 
 
 		 259 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 259 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  52.02 
 
 		 294 aa  244  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  51.21 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  51.21 
 
 		 278 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  51.21 
 
 		 278 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  51.21 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  51.21 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  51.21 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  51.21 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2619  DeoR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 256 aa  241  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  50.4 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  51.21 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  50.81 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  51.21 
 
 		 251 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  51.87 
 
 		 251 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 286 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 251 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  50.4 
 
 		 259 aa  235  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  49.79 
 
 		 257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  45.93 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  45.12 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1439  transcriptional regulator, DeoR family  48.31 
 
 		 275 aa  226  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0159016  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  45.8 
 
 		 255 aa  225  7e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  44.4 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  45.12 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  44.72 
 
 		 252 aa  222  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  44.72 
 
 		 252 aa  222  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  45.53 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  45.53 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  45.53 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  50.87 
 
 		 251 aa  221  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 256 aa  221  9e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  48.52 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  48.52 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  44.12 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2180  DeoR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  45.87 
 
 		 252 aa  218  7.999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3044  glycerol-3-phosphate regulon repressor transcription regulator protein  49.36 
 
 		 261 aa  217  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453979  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  47.24 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  43.9 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  43.9 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  43.9 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  43.9 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2979  transcriptional regulator, DeoR family  47.24 
 
 		 257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  43.9 
 
 		 252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  43.78 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2210  DeoR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4258  glycerol-3-phosphate regulon repressor  42.52 
 
 		 267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4414  glycerol-3-phosphate regulon repressor  42.52 
 
 		 267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4303  glycerol-3-phosphate regulon repressor  42.52 
 
 		 267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4349  glycerol-3-phosphate regulon repressor  42.52 
 
 		 267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4236  glycerol-3-phosphate regulon repressor  42.52 
 
 		 267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1769  DeoR family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.125805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  42.68 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  42.68 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  42.68 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  42.68 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  42.68 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  42.68 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  41.43 
 
 		 270 aa  209  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  42.68 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  42.68 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3832  DeoR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 277 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2235  DeoR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 259 aa  208  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859699  normal  0.0514044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>