More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0922 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 248 aa  508  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  53.63 
 
 		 261 aa  261  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  44.58 
 
 		 249 aa  211  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  40.16 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  38.1 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  43.25 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  37.9 
 
 		 249 aa  181  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 251 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 267 aa  175  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  36.14 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  36.55 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  38.71 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  39.68 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  36.95 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  37.39 
 
 		 248 aa  158  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  36.78 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  37.39 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  36.96 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  37.39 
 
 		 250 aa  155  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  35.74 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 251 aa  154  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  35.74 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  36.09 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  31.45 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  35.5 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  35.34 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  35.08 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  39.08 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  36.07 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  34.14 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  33.77 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  32.53 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  34.47 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  35.9 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 255 aa  135  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  32.24 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  36.32 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  34.05 
 
 		 253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  31.28 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  33.2 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 259 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  29.82 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  32.46 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  33.48 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 284 aa  124  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  29.33 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 376 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  31.89 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  31.3 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 264 aa  121  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  32.03 
 
 		 252 aa  122  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  31.2 
 
 		 268 aa  121  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  31.62 
 
 		 253 aa  118  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  33.91 
 
 		 267 aa  118  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 288 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  31.9 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  28.95 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>