More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1182 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
286 aa  557  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  88.45 
 
 
315 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  88.49 
 
 
376 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  88.69 
 
 
274 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  88.69 
 
 
274 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  88.69 
 
 
274 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  89.62 
 
 
260 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  89.23 
 
 
260 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  71.54 
 
 
260 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  50.97 
 
 
260 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  50.58 
 
 
260 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  40.47 
 
 
270 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  42.86 
 
 
258 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  43.72 
 
 
253 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
265 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  37.92 
 
 
256 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  37.7 
 
 
253 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  41.67 
 
 
258 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
257 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 
259 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  38.77 
 
 
251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  35.97 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  39.11 
 
 
251 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  38.2 
 
 
261 aa  145  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
251 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
251 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
251 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
251 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  39.15 
 
 
251 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  32.14 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  37.25 
 
 
252 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  43.11 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  38.86 
 
 
254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  37.39 
 
 
253 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
231 aa  132  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  33.48 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  36 
 
 
255 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
251 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  37.8 
 
 
251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  37.14 
 
 
250 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  36.4 
 
 
255 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
253 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  39.35 
 
 
252 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  28.4 
 
 
257 aa  123  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  28.89 
 
 
248 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
254 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  34.87 
 
 
251 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  29.91 
 
 
253 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  36.67 
 
 
251 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
253 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03885  transcriptional regulator, DeoR family protein  32.06 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.81593  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  30.42 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3442  transcriptional regulator, DeoR family  37.35 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000177835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  34.76 
 
 
252 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  31 
 
 
253 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  33.33 
 
 
278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1380  transcriptional regulator, DeoR family  28.22 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3964  transcriptional regulator, DeoR family  28.22 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1053  DeoR family transcriptional regulator  28.39 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1417  transcriptional regulator, DeoR family  28.22 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.381342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1242  DeoR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1218  DeoR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.46178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1220  DeoR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.373784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1343  DeoR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  29.48 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  33.46 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  33.77 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1442  DeoR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0258355  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  34.06 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  30.2 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1483  transcriptional regulator, DeoR family  28.22 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  30.65 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  32.66 
 
 
253 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
254 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.23 
 
 
269 aa  112  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  34.62 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
256 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1243  DeoR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  29.44 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.91 
 
 
257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.2 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.8 
 
 
269 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.8 
 
 
269 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  28.8 
 
 
269 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  37.13 
 
 
253 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  28.8 
 
 
269 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.8 
 
 
269 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.23 
 
 
269 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.8 
 
 
269 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  32.72 
 
 
253 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.8 
 
 
269 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  34.45 
 
 
253 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>