More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0061 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 376 aa  729    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  99.02 
 
 		 315 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 274 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 274 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 274 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  99.62 
 
 		 260 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  88.49 
 
 		 286 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 260 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 260 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 260 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 270 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  43.4 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  45.81 
 
 		 253 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 256 aa  163  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 257 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 265 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  39.64 
 
 		 259 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  38.11 
 
 		 251 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  42.06 
 
 		 258 aa  150  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  39.13 
 
 		 259 aa  149  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  35.66 
 
 		 253 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 251 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 251 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 257 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 251 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  38.06 
 
 		 252 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 251 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 251 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 251 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  44.89 
 
 		 266 aa  136  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  36.29 
 
 		 261 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  39.38 
 
 		 254 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  38.72 
 
 		 253 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  31.76 
 
 		 247 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  39.65 
 
 		 250 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 251 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  29.71 
 
 		 248 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  35.91 
 
 		 251 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 231 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  39.35 
 
 		 252 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  35.27 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  34.35 
 
 		 259 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  36.59 
 
 		 251 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  30.13 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  30.38 
 
 		 255 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 253 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  30.31 
 
 		 258 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  35.21 
 
 		 251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 253 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  32.14 
 
 		 253 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  34.29 
 
 		 252 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  36.62 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 253 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  38.24 
 
 		 253 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  33.81 
 
 		 278 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  31.17 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  26.43 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  31.17 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1070  transcriptional regulator, DeoR family  26.64 
 
 		 256 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167958  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  29.2 
 
 		 249 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 253 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0277  transcriptional regulator, DeoR family  29.69 
 
 		 245 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  30.74 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  29.69 
 
 		 253 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 253 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 268 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  30 
 
 		 248 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1380  transcriptional regulator, DeoR family  28.45 
 
 		 260 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 254 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03885  transcriptional regulator, DeoR family protein  30.42 
 
 		 269 aa  106  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.81593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1242  DeoR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 260 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1218  DeoR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 260 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.46178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1220  DeoR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 260 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.373784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1343  DeoR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 260 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3964  transcriptional regulator, DeoR family  28.45 
 
 		 260 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1417  transcriptional regulator, DeoR family  28.45 
 
 		 260 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.381342 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  28.7 
 
 		 247 aa  106  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  34.18 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1442  DeoR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0258355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3442  transcriptional regulator, DeoR family  36.6 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000177835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1483  transcriptional regulator, DeoR family  28.45 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.51 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  35.06 
 
 		 255 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  26.95 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  24.78 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  34.06 
 
 		 256 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  28.44 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.83 
 
 		 252 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.63 
 
 		 269 aa  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>