More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4140 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  91.9 
 
 		 248 aa  462  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  89.88 
 
 		 248 aa  454  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  58.01 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  56.2 
 
 		 249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  50.2 
 
 		 248 aa  251  8.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  49.79 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  49.79 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 258 aa  216  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  38.84 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  35.34 
 
 		 252 aa  158  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  36.78 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  33.87 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  36.96 
 
 		 253 aa  152  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  35.21 
 
 		 254 aa  151  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  38.31 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 		 252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  34.27 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 251 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  35 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 251 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  38.26 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  33.74 
 
 		 251 aa  138  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 251 aa  138  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  31.82 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  32.4 
 
 		 250 aa  128  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  35.08 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  31.4 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 270 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  32.8 
 
 		 249 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  34.78 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  32.26 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  29.84 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  29.15 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  33.48 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  28.45 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  28.92 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  29.54 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  28 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4788  transcriptional regulator, DeoR family  27.35 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478431  hitchhiker  0.0000516883 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  28.44 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  29.71 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  30.17 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 376 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  29.6 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0770  DeoR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0577  DeoR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0689  DeoR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2090  DeoR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1995  DeoR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1642  DeoR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  29.83 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0889  DeoR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 348 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  29.74 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0505  DeoR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 407 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4993  DeoR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3092  DeoR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5275  DeoR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 265 aa  99  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0375  DeoR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 252 aa  98.6  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  27.71 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  28.38 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  27.71 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02920  transcriptional regulator of sugar metabolism  30.36 
 
 		 276 aa  97.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  27.71 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  28.51 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1427  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.847076  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 266 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  25.32 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  26.18 
 
 		 256 aa  95.5  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  28.57 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  27.97 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>