More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0910 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 258 aa  506  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  39.75 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  38.49 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  36.44 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  39.22 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 286 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  40.89 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 260 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  42.74 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  36.95 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  42.74 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  40.48 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  39.29 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  40.08 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  36.14 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  38.55 
 
 		 252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  37.2 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  34.14 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  41.2 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  37.77 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  31.85 
 
 		 249 aa  131  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  36.8 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  37.72 
 
 		 251 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  34.52 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  29.92 
 
 		 253 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  34.94 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  31.75 
 
 		 253 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  36.92 
 
 		 260 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  34.94 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.62 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  36.09 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.33 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.33 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.33 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.09 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.09 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  32.53 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1070  transcriptional regulator, DeoR family  28.07 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167958  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.2 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.2 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  30.92 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  31.33 
 
 		 252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  30.77 
 
 		 252 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  30.77 
 
 		 252 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.62 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1936  transcriptional regulator, DeoR family  24.41 
 
 		 253 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000701948  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.62 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  27.71 
 
 		 253 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  34.71 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0660  transcriptional regulator, DeoR family  29.65 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  28.92 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  29.52 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  30.84 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  31.17 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.6 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.62 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.62 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.6 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.6 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.6 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  35.93 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.6 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.62 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.33 
 
 		 258 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  30.84 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>