More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0901 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 251 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  95.22 
 
 		 251 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  63.22 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  51.21 
 
 		 251 aa  258  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 267 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  52.92 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  52.92 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  55.17 
 
 		 254 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  57.62 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 251 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  52.4 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  50.88 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  50.21 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  48.15 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  44.63 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  40.59 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  37.13 
 
 		 259 aa  161  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  36.36 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  36.07 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  34.14 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  39.36 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  37.6 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  38.16 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  32.11 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  38.14 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  33.48 
 
 		 249 aa  136  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  37.66 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 		 249 aa  134  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  36 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  34.57 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  30.58 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  31.4 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  30.04 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  34.84 
 
 		 260 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 270 aa  122  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 315 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  34.15 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  30.33 
 
 		 247 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 376 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 256 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 256 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  29.51 
 
 		 253 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 231 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  37.38 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  31 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.29 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  35 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  29.75 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.06 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  29.75 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  34.05 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  32.64 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  34.58 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  33.04 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  37.09 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  33.88 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  29.8 
 
 		 249 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  31.1 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.51 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  32.72 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>