More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1875 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 259 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  62.35 
 
 		 259 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  55.83 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  51.38 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 256 aa  268  8.999999999999999e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  44.3 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  43.75 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 254 aa  178  9e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  40.89 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  39.82 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  39.75 
 
 		 258 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  40.59 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  39.91 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  37.39 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  37.13 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  37.75 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  37.01 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 376 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  34.02 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  34.96 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 270 aa  142  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  35.84 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  31.98 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  34.69 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  35.42 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  32.66 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  37.14 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 284 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  31.28 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  33.19 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  34.75 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  37.6 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  33.62 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  32.49 
 
 		 253 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  31.62 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  32.77 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  32.07 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  32.92 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2594  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  29.48 
 
 		 249 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  32.51 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  35.71 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  32.61 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  30.54 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  32.1 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  32.1 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  32.1 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  31.69 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  30.36 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  29.64 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  28.45 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  29.84 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  32.62 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8218  transcriptional regulator, DeoR family  35.59 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437389  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  29.22 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  29.22 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  29.22 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 256 aa  111  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 255 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 255 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 255 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  29.22 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  29.22 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  32.71 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  30.74 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>