More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3064 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  95.77 
 
 		 260 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  49.81 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 274 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 274 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 274 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 260 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  51.97 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  50.58 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 376 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  45.2 
 
 		 265 aa  182  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  43.53 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 266 aa  161  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  43.32 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  38.7 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  41.11 
 
 		 258 aa  158  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  34 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  34.44 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 267 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  37.66 
 
 		 259 aa  151  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  38.8 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  33.64 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  36.51 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  34.94 
 
 		 253 aa  135  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  41.01 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  34 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  35.63 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  38.11 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  35.86 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  38.4 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  33.86 
 
 		 253 aa  125  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 		 251 aa  121  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  35.08 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  29.63 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  37.14 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 255 aa  118  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  35.92 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  32.62 
 
 		 253 aa  116  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  31.44 
 
 		 253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  30.53 
 
 		 249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  30.95 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  28.92 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  26.41 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  29.61 
 
 		 249 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  29.44 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  34.11 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  29.53 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  31.9 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  29.67 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.9 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.9 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.9 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.9 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  31.9 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.9 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.9 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  35.21 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  31.9 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  33.63 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1449  DeoR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1936  transcriptional regulator, DeoR family  25.79 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000701948  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0098  DeoR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267831  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  35.42 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.43 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.43 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.43 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.43 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  29.32 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.43 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  32.03 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  30.21 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3258  DeoR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000943791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  30 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0718  DeoR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000222584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>