More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2290 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 251 aa  494  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  77.6 
 
 		 253 aa  388  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  67.73 
 
 		 251 aa  322  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  63.35 
 
 		 251 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  62.95 
 
 		 251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  62.95 
 
 		 251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  62.95 
 
 		 251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  62.55 
 
 		 251 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 267 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  60.16 
 
 		 251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  60.16 
 
 		 251 aa  292  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  56.57 
 
 		 254 aa  261  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  50.4 
 
 		 252 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  49.79 
 
 		 251 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  50.21 
 
 		 251 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  49.4 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  47.33 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  48.51 
 
 		 250 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  40.8 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  36.95 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  40.69 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  36.93 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  39.38 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  38.26 
 
 		 248 aa  156  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  35.89 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  34.68 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  36.96 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  37.14 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  35.86 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  36.86 
 
 		 247 aa  149  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  38.4 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  34.2 
 
 		 249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 270 aa  145  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 256 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  35.93 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  32.65 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  38.26 
 
 		 258 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  34.7 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  31.2 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  37.6 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 260 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  35.18 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 274 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 274 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 274 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 315 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  36 
 
 		 260 aa  134  9e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 231 aa  135  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  34.78 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 376 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  36.18 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 266 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  33.99 
 
 		 253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  36.7 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  38.5 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  31.84 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  31.49 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.08 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  30.71 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 258 aa  125  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  37.17 
 
 		 250 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  37.76 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5838  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  36.29 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  37.25 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 284 aa  121  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  35.48 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 255 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.08 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.28 
 
 		 269 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.28 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  30.28 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.28 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.28 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  30.28 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.28 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.28 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  34.91 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  39.57 
 
 		 248 aa  119  6e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  34.94 
 
 		 255 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>