More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4860 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  552  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  49.61 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  51.41 
 
 		 249 aa  264  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  45.22 
 
 		 248 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  40.65 
 
 		 249 aa  204  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  38 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  38.84 
 
 		 249 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  37.85 
 
 		 248 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  36.29 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  34.54 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  32.26 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  32.53 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  36.29 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  35.74 
 
 		 249 aa  145  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  35.19 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  37.34 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 256 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  32.79 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  32.22 
 
 		 252 aa  142  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  34.14 
 
 		 249 aa  141  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  36 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  27.71 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  34.94 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  34.94 
 
 		 248 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  32.11 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  33.47 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  30.12 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  29.44 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  32.24 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  31.54 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  29.48 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  30.45 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  32.91 
 
 		 248 aa  122  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  31.51 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 253 aa  119  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  33.07 
 
 		 256 aa  118  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  29.22 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  31.54 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  32.38 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  31.97 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.51 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.51 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.51 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  29.92 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.1 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  29.88 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.28 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.28 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  30.36 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2499  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  30.54 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.28 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2920  transcriptional regulator, DeoR family  32.68 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  28.85 
 
 		 258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  27.6 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  30.6 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 242 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  30.45 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  30.45 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.86 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  29.87 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.45 
 
 		 252 aa  109  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.45 
 
 		 252 aa  109  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.45 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.45 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.45 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.71 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.45 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.45 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  31.47 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.45 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.45 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.45 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>