More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3432 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 249 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  56.05 
 
 		 249 aa  287  9e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  36.69 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  34.68 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  34.66 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  31.85 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  31.85 
 
 		 258 aa  131  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  31.35 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  29.84 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  30.65 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  35.8 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  33.47 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  34.02 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  32.93 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  32.35 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  32.8 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  29.48 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  29.64 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  31.08 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  28.11 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  31.05 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  31.44 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  33.2 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  32 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  31.65 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  30.21 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  30.67 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  29.79 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  30.33 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  27.02 
 
 		 251 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  31.82 
 
 		 249 aa  111  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 284 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  27.69 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  27.53 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  30.21 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  28.12 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  30.58 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  29.06 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  29.58 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  26.1 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  28.23 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  28.81 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  27.27 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  26.09 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  28.16 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  29.2 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2425  DeoR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4674  DeoR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2470  DeoR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  28.28 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  28.97 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  29.49 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3722  DeoR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 251 aa  99  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  28 
 
 		 253 aa  98.6  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5164  DeoR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 252 aa  98.6  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1308  transcriptional regulator, DeoR family  29.61 
 
 		 250 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1563  transcriptional regulator, DeoR family  29.61 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0289258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0851  fructose operon transcriptional regulator  27.39 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.151566  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5838  DeoR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1363  regulatory protein DeoR  29.61 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.212224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4635  DeoR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3114  DeoR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283003  hitchhiker  0.000123192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  24.89 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  29.63 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3257  transcriptional regulator, DeoR family  26.69 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.9425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  27.95 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3442  transcriptional regulator, DeoR family  28.4 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000177835  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  27.49 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2464  DeoR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>