More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5838 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5838  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
256 aa  507  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6108  DeoR family transcriptional regulator  79.05 
 
 
268 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2591  DeoR family transcriptional regulator  67.97 
 
 
258 aa  316  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.759776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0561  transcriptional regulator, DeoR family  62.6 
 
 
254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.725961 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6957  DeoR family transcriptional regulator  60.16 
 
 
268 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6298  DeoR family transcriptional regulator  60.16 
 
 
268 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.7128 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5960  DeoR family transcriptional regulator  60.8 
 
 
268 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1531  DeoR family transcriptional regulator  60.16 
 
 
268 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3564  DeoR family transcriptional regulator  53.94 
 
 
264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0635844  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4425  DeoR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612915  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1034  DeoR family transcriptional regulator  47.35 
 
 
268 aa  178  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.631262  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1101  transcriptional regulator, DeoR family  46.46 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
254 aa  148  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
260 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4365  transcriptional regulator, DeoR family  40.25 
 
 
262 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
265 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  40.76 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  37.4 
 
 
260 aa  135  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  35.25 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  42.86 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  38.75 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  39.06 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  32.37 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  31.97 
 
 
250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1023  DeoR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
202 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  37.96 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  35.95 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  37.96 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
251 aa  125  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  30.89 
 
 
252 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
260 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3265  transcriptional regulator, DeoR family  39.41 
 
 
277 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213162  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
248 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  32.91 
 
 
248 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  31 
 
 
274 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
260 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  34.12 
 
 
254 aa  121  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
259 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  35.95 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  29.51 
 
 
247 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  35.45 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  37.44 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  33.65 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
261 aa  119  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.55 
 
 
252 aa  119  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  39.13 
 
 
248 aa  118  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
256 aa  118  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.09 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2456  transcriptional regulator, DeoR family  38.77 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  34.94 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.09 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.09 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.09 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.09 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  37.71 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  36.25 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  32.64 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  34 
 
 
258 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1357  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 
263 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2894  transcriptional regulator, DeoR family  40.28 
 
 
265 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0151849 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.64 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.64 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.64 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.64 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  33.64 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  37.27 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36.11 
 
 
252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  35.22 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  32.65 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.64 
 
 
252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  33.64 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.64 
 
 
252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  36.99 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  31.2 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  32.8 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.65 
 
 
252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.65 
 
 
252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.65 
 
 
252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  33.64 
 
 
252 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  31.89 
 
 
263 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  32.09 
 
 
263 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  35.78 
 
 
258 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
249 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>