More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4889 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
264 aa  501  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  42.15 
 
 
242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  40.08 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  40.54 
 
 
254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8645  transcriptional regulator, DeoR family  42.31 
 
 
253 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.846335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6212  transcriptional regulator, DeoR family  37.82 
 
 
261 aa  142  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  0.761019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  40.52 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  40.77 
 
 
262 aa  139  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2425  DeoR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2470  DeoR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445406  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2464  DeoR family transcriptional regulator  39.83 
 
 
258 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21816  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  36.98 
 
 
261 aa  133  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  39.66 
 
 
261 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  35.12 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  31.28 
 
 
250 aa  131  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2626  DeoR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
273 aa  131  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  37.45 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1357  transcriptional regulator, DeoR family  36.13 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  36.91 
 
 
253 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8218  transcriptional regulator, DeoR family  39.68 
 
 
263 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437389  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  35.84 
 
 
253 aa  125  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  38.49 
 
 
261 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
259 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
288 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  38.93 
 
 
289 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  40.26 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  38.01 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  30.89 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02920  transcriptional regulator of sugar metabolism  36.8 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  37.44 
 
 
249 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2706  transcriptional regulator, DeoR family  39.13 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  40.54 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
260 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  34.36 
 
 
258 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8240  transcriptional regulator protein  37.28 
 
 
261 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.647989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
260 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  38.76 
 
 
254 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  38.75 
 
 
254 aa  118  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5838  DeoR family transcriptional regulator  39.43 
 
 
256 aa  118  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
285 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3971  transcriptional regulator, DeoR family  43.25 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.229273  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  33.33 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  34.39 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  36.1 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  29.74 
 
 
254 aa  116  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0130  regulatory protein, DeoR  36.64 
 
 
281 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1363  regulatory protein DeoR  34.21 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.212224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1563  transcriptional regulator, DeoR family  34.21 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0289258  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  30.12 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  37.66 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  32.84 
 
 
257 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2210  DeoR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1308  transcriptional regulator, DeoR family  34.05 
 
 
250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225197  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  32.92 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16690  transcriptional regulator, DeoR family  38.33 
 
 
261 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
254 aa  112  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0882  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 
277 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.262564  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  30.27 
 
 
278 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  29.74 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  32.46 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4986  transcriptional regulator, DeoR family  35.68 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0285298  normal  0.0212972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  32.46 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  32.46 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.66 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
251 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  27.6 
 
 
250 aa  111  9e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  33.91 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2824  DeoR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1460  DeoR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585922  normal  0.541781 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2746  DeoR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.437292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  29.61 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1101  transcriptional regulator, DeoR family  35.15 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  38.08 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  33.21 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
261 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
261 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  37.09 
 
 
268 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  30.86 
 
 
259 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  25.94 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.24 
 
 
252 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  31.09 
 
 
259 aa  109  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.24 
 
 
252 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.24 
 
 
252 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.28 
 
 
252 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.24 
 
 
252 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  35.39 
 
 
278 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>