More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2706 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2706  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
252 aa  484  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  48.1 
 
 
242 aa  204  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8645  transcriptional regulator, DeoR family  49.79 
 
 
253 aa  195  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.846335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  43.6 
 
 
252 aa  184  9e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  40.96 
 
 
254 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4140  DeoR family transcriptional regulator  42.29 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4431  regulatory protein, DeoR  47.89 
 
 
194 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74821  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  35.22 
 
 
258 aa  139  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
260 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  31.23 
 
 
252 aa  132  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
268 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  30.52 
 
 
263 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.51 
 
 
257 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
261 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  30.52 
 
 
263 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  36.65 
 
 
253 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  32.79 
 
 
248 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
285 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
254 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  31.02 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  29.55 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.15 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.27 
 
 
252 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.27 
 
 
252 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.59 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.01 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.89 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.01 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.01 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.01 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.2 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.2 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  27.82 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  29.32 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  39.13 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.2 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  35.06 
 
 
253 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000701  putative regulatory protein  31.97 
 
 
246 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.456965  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.62 
 
 
252 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  33.73 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  35.6 
 
 
254 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  27.82 
 
 
254 aa  115  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.08 
 
 
252 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.08 
 
 
252 aa  115  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  29.08 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  32.14 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  29.08 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  29.32 
 
 
254 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.08 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1363  regulatory protein DeoR  34.92 
 
 
250 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.212224 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  29 
 
 
256 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.08 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1563  transcriptional regulator, DeoR family  34.52 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0289258  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  29.72 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.08 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06583  hypothetical protein  31.15 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.08 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2619  DeoR family transcriptional regulator  31.23 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
277 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
284 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.271905 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  29.08 
 
 
252 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 
262 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  28.57 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  28.57 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  26.14 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  32.33 
 
 
256 aa  111  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
261 aa  111  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6212  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
261 aa  111  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  0.761019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.25 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.25 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  35.65 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  36.33 
 
 
254 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
260 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.39 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
254 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.34 
 
 
269 aa  109  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1308  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225197  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.96 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  29.64 
 
 
251 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1048  DeoR family transcriptional regulator  30.74 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
266 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  30.31 
 
 
253 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 
253 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  31.58 
 
 
250 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
286 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  31.02 
 
 
257 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>