More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4140 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4140  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8645  transcriptional regulator, DeoR family  49.15 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.846335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  44.27 
 
 		 252 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  40.87 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2706  transcriptional regulator, DeoR family  42.29 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4431  regulatory protein, DeoR  44.62 
 
 		 194 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  35.98 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  29.53 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  34.04 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  36.32 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  30.4 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  29.3 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.05 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  32.77 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  33.73 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  30.04 
 
 		 275 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  32.82 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.43 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  32.43 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  32.43 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.43 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.43 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.43 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.43 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  35.83 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  32.23 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.43 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.31 
 
 		 252 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.78 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  27.42 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  30.6 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.92 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.92 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  35.14 
 
 		 256 aa  98.6  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  34.7 
 
 		 259 aa  98.6  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.76 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  35.16 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  29.79 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  28.4 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  26.56 
 
 		 252 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2425  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2470  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 251 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 248 aa  96.3  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  27.97 
 
 		 252 aa  95.9  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  30.08 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  28.86 
 
 		 252 aa  95.5  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2464  DeoR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 258 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3971  transcriptional regulator, DeoR family  33.06 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.229273  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.22 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  30.29 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.92 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  34.03 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.13 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  28.68 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  27.09 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  30.33 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0542275 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.93 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2456  DeoR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1537  DeoR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000092764  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.93 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  27.94 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.72 
 
 		 278 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  28.4 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  25.78 
 
 		 248 aa  93.2  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  28.81 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2626  DeoR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 273 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  28.81 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  28.81 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4236  glycerol-3-phosphate regulon repressor  28.24 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4303  glycerol-3-phosphate regulon repressor  28.24 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4414  glycerol-3-phosphate regulon repressor  28.24 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  28.81 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>