More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0750 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
259 aa  510  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  90.31 
 
 
259 aa  455  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  81.57 
 
 
255 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  81.57 
 
 
255 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  81.57 
 
 
255 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  58.82 
 
 
255 aa  288  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  58.04 
 
 
255 aa  274  9e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  57.03 
 
 
256 aa  268  7e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  53.7 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  51.3 
 
 
269 aa  236  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  51.84 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  51.12 
 
 
268 aa  226  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  49.02 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  48.63 
 
 
253 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  49.41 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  48.62 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  49.21 
 
 
253 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  48.63 
 
 
253 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  51.37 
 
 
253 aa  208  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
253 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  47.21 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  49.8 
 
 
253 aa  196  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  41.57 
 
 
260 aa  174  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
254 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  37.7 
 
 
253 aa  169  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  40.93 
 
 
258 aa  166  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  38.34 
 
 
250 aa  165  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
267 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  43.59 
 
 
254 aa  158  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
252 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  33.87 
 
 
257 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  38.04 
 
 
253 aa  151  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  34.9 
 
 
257 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 
267 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  41.32 
 
 
252 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
251 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  41.86 
 
 
253 aa  149  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  40.17 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  36.08 
 
 
257 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  38.82 
 
 
257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
256 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  36.72 
 
 
261 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  38.89 
 
 
266 aa  141  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  37.87 
 
 
264 aa  141  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  36.33 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  40.08 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  33.33 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  36.08 
 
 
252 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  35.43 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  35.43 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.43 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.43 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  35.43 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.43 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.43 
 
 
269 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.43 
 
 
269 aa  139  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  36.58 
 
 
259 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  36.58 
 
 
257 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  36.58 
 
 
257 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  36.58 
 
 
257 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  36.58 
 
 
259 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  31.23 
 
 
249 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  36.58 
 
 
257 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  37.7 
 
 
254 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0011  sugar metabolism transcriptional regulator  32.41 
 
 
252 aa  137  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.24 
 
 
257 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.24 
 
 
257 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.24 
 
 
257 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  34.24 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  34.24 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.24 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.24 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  34.24 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  34.87 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.24 
 
 
257 aa  136  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.63 
 
 
257 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.63 
 
 
257 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.63 
 
 
257 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.63 
 
 
257 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.63 
 
 
257 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  33.98 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.33 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  34.88 
 
 
257 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  36.6 
 
 
256 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  32.67 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  35.18 
 
 
288 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  32.67 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  34.88 
 
 
257 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
253 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  35.63 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.56 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1728  lactose transport regulator  38.43 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2920  transcriptional regulator, DeoR family  37.35 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>