More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5399 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  57.32 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8645  transcriptional regulator, DeoR family  57.92 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.846335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  54.39 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4431  regulatory protein, DeoR  58.76 
 
 		 194 aa  204  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2706  transcriptional regulator, DeoR family  48.1 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4140  DeoR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.24 
 
 		 250 aa  161  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 268 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2425  DeoR family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2470  DeoR family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2464  DeoR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  36.84 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2626  DeoR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 273 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  38.1 
 
 		 248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  39.83 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  42.55 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  41.44 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  39.46 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  35.81 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  32.48 
 
 		 254 aa  135  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  39.25 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  38.72 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 253 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6212  transcriptional regulator, DeoR family  35.8 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  0.761019 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1265  DeoR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.940164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  35.15 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  40.17 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  37.73 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  30.08 
 
 		 257 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1758  regulatory protein DeoR  38.99 
 
 		 249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  28.83 
 
 		 252 aa  125  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  34.14 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.76 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  38.59 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1833  transcriptional regulator, DeoR family  34.62 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333154  decreased coverage  0.0000836865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1828  DeoR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.582122  hitchhiker  1.2930800000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1445  transcriptional regulator, DeoR family  34.62 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1627  DeoR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  3.75705e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1890  DeoR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000038281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  30.64 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.5 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  37.39 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 294 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  35.19 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.06 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.06 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.06 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.06 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  29.46 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.06 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  40.09 
 
 		 253 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  34.39 
 
 		 263 aa  121  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  35.96 
 
 		 266 aa  121  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.06 
 
 		 278 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36.07 
 
 		 252 aa  121  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.06 
 
 		 278 aa  121  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  31.09 
 
 		 254 aa  121  9e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  37.16 
 
 		 262 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  35.84 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2184  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388105 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01920  transcriptional regulator of sugar metabolism  35.47 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  37.12 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  34.36 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4986  transcriptional regulator, DeoR family  35.02 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0285298  normal  0.0212972 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.62 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  36 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 256 aa  118  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.79 
 
 		 252 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>