More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2651 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
250 aa  511  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  77.42 
 
 
250 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  60 
 
 
249 aa  300  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  56.91 
 
 
250 aa  295  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  56.91 
 
 
250 aa  294  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  56.91 
 
 
250 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  56.5 
 
 
250 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  56.5 
 
 
250 aa  292  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  57.14 
 
 
250 aa  292  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  56.73 
 
 
250 aa  292  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  55.69 
 
 
250 aa  291  8e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  56.5 
 
 
250 aa  290  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  56.5 
 
 
250 aa  290  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  52.42 
 
 
248 aa  265  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  52.02 
 
 
248 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  48.7 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  46.72 
 
 
253 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  46.72 
 
 
253 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  43.9 
 
 
248 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  46.67 
 
 
247 aa  206  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0108  transcriptional regulator, DeoR family  43.23 
 
 
236 aa  194  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  45.26 
 
 
233 aa  187  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3760  transcriptional regulator, DeoR family  39.67 
 
 
245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  39.18 
 
 
247 aa  177  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1728  lactose transport regulator  40.32 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0381  transcriptional regulator, DeoR family  42.17 
 
 
229 aa  169  5e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000667936  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  40.57 
 
 
256 aa  159  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0617  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
244 aa  156  3e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0340612  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  39.83 
 
 
256 aa  156  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
274 aa  155  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.4 
 
 
250 aa  155  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  35.98 
 
 
254 aa  148  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  39.57 
 
 
253 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
269 aa  142  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
260 aa  142  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0277  transcriptional regulator, DeoR family  37.18 
 
 
245 aa  142  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  39.91 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  37.13 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 
260 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
252 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0635  DeoR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000201895  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  34.41 
 
 
268 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  36.32 
 
 
266 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
264 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  39.55 
 
 
253 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  38.66 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.96 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
253 aa  134  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  34.57 
 
 
258 aa  135  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  35.59 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  37.11 
 
 
282 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  34.2 
 
 
248 aa  132  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  33.77 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  36.64 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  35.48 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
253 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  32.55 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1053  DeoR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3257  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.9425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  34.98 
 
 
266 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  35.74 
 
 
253 aa  128  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  37.66 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  36.91 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 
267 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 
253 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3964  transcriptional regulator, DeoR family  32.6 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  33.77 
 
 
254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1380  transcriptional regulator, DeoR family  32.31 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1242  DeoR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
260 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1218  DeoR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
260 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.46178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1417  transcriptional regulator, DeoR family  32.6 
 
 
260 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.381342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1220  DeoR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
260 aa  125  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.373784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1343  DeoR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
260 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  31.9 
 
 
249 aa  125  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
253 aa  125  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  38.46 
 
 
253 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1243  DeoR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
260 aa  125  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1442  DeoR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
260 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0258355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.5 
 
 
257 aa  125  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1483  transcriptional regulator, DeoR family  32.6 
 
 
260 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  35.29 
 
 
257 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  35.71 
 
 
267 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
288 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  35.71 
 
 
253 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  35.9 
 
 
253 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
263 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.11 
 
 
269 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  34.5 
 
 
255 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  33.04 
 
 
257 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  33.47 
 
 
278 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
259 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
260 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>