More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1854 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  100 
 
 		 252 aa  489  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  57.32 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8645  transcriptional regulator, DeoR family  57.76 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.846335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  54.62 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4431  regulatory protein, DeoR  53.61 
 
 		 194 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4140  DeoR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2706  transcriptional regulator, DeoR family  43.6 
 
 		 252 aa  178  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.8 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2425  DeoR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 258 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2470  DeoR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 258 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  38 
 
 		 253 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2464  DeoR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  37.2 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  37.75 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  35.04 
 
 		 257 aa  141  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2626  DeoR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 273 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  39.17 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4889  transcriptional regulator, DeoR family  38.43 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.585335  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  38.1 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  36.82 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  36.89 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  31.08 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  40.17 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  36.48 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  31.87 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  36.76 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  37.7 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  32.34 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  40.4 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  37.4 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 256 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  34.75 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.19 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  31.89 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.19 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  33.47 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  33.46 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  31.22 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  37.3 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  33.06 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  33.06 
 
 		 257 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  33.06 
 
 		 257 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  33.06 
 
 		 257 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 257 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 253 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  30.28 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.76 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.76 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  33.99 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.76 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  36.9 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  31.4 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  31.13 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  35.02 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  35.02 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  35.02 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.76 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.73 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  35.02 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  35.59 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.19 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  36.91 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.19 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.02 
 
 		 269 aa  122  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  30.74 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.48 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  32.14 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  32.14 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.48 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.48 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.14 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.14 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.14 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  35.22 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.47 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>