More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1790 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 259 aa  524  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  62.35 
 
 		 259 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  53.72 
 
 		 256 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 257 aa  262  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  51.05 
 
 		 257 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  45.57 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  46.49 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  41.06 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  37.66 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  36.84 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  38.59 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  39.22 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 270 aa  158  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  39.74 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 376 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 		 253 aa  155  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 267 aa  154  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 286 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  37.13 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  37 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  36.68 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  38.16 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 251 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  34.8 
 
 		 249 aa  141  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  33.77 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  36 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  32.92 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  34.06 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  34.02 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  39.38 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  33.61 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  35.37 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  34.05 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  31.73 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  32.89 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 277 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4674  DeoR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  33.47 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  33.6 
 
 		 248 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  35.24 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  35.59 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7268  transcriptional regulator DeoR family  33.89 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.254558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  32.31 
 
 		 260 aa  118  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 231 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  32.26 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  32.77 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0708  DeoR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  33.81 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  34.05 
 
 		 258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0718  DeoR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000222584  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  32.9 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  31.28 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.61 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  32.16 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  31.93 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0660  transcriptional regulator, DeoR family  29.36 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  31.93 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 250 aa  111  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.99 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.99 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  30.99 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  30.99 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.99 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  34.03 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.99 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.99 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  31.49 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>