More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3069 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  100 
 
 		 259 aa  523  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  99.61 
 
 		 259 aa  522  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  99.61 
 
 		 257 aa  518  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  99.61 
 
 		 257 aa  518  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  99.61 
 
 		 257 aa  518  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  99.61 
 
 		 257 aa  518  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  73.15 
 
 		 257 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  72.76 
 
 		 257 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  72.76 
 
 		 257 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  72.76 
 
 		 257 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  72.76 
 
 		 257 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  55.38 
 
 		 263 aa  293  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  37.8 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  37.8 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  37.8 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  37.8 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  37.8 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  37.8 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  37.8 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  38.58 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  37.8 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.45 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.06 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.06 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  39.06 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  39.06 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.06 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  39.06 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.06 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.45 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.06 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.45 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.45 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.45 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.45 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  39.53 
 
 		 250 aa  164  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  37.21 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4041  transcriptional regulator, DeoR family protein  37.89 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112055  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.08 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.61 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3840  DeoR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.897226  hitchhiker  0.000196031 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3744  regulatory protein, DeoR  38.33 
 
 		 256 aa  159  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 264 aa  159  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  37.31 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  38.8 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  38.8 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 257 aa  156  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4893  DeoR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4235  DeoR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00275113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4503  DeoR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259499  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5118  regulatory protein, DeoR  38.28 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5727  DeoR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  39.33 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2823  putative glucitol operon repressor  37.35 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0038  DeoR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5596  transcriptional regulator, DeoR family  39.66 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4361  DeoR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.14783  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  36.55 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03885  transcriptional regulator, DeoR family protein  35.83 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.81593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4742  DeoR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4362  DeoR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0187642  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3952  DeoR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00923928  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5197  DeoR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.342459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4482  DeoR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000793967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1537  DeoR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000092764  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4013  DeoR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4126  DeoR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.138481  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4306  transcriptional regulator, DeoR family  37.35 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121893 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4603  DeoR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5410  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.378654  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3921  DeoR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230254  normal  0.0231627 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5292  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3640  DeoR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000875661  normal  0.0587725 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00830  transcriptional regulator  36.86 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  38.37 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0673  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  37.5 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5428  DeoR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001644  transcriptional regulator of GlmS, DeoR family  36.86 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00296274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  40.08 
 
 		 248 aa  141  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4943  DeoR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3949  chitinase II  36.47 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.985635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  36.97 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  33.98 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 274 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 252 aa  138  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  36.71 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>