More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4225 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 253 aa  501  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  68 
 
 		 253 aa  337  8e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  66.4 
 
 		 253 aa  322  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  65.74 
 
 		 253 aa  321  7e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  68.4 
 
 		 253 aa  310  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  64.8 
 
 		 253 aa  298  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  60.4 
 
 		 253 aa  281  7.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  57.09 
 
 		 253 aa  271  8.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  56.4 
 
 		 253 aa  267  8.999999999999999e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  58.87 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  56.8 
 
 		 253 aa  265  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  58.78 
 
 		 253 aa  254  7e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  49.6 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  48.43 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  47.98 
 
 		 252 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  46.8 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 269 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  45.3 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  42.04 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  41.76 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  39.22 
 
 		 250 aa  166  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  35.18 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  41.7 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 264 aa  158  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  40.17 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  42.17 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  35.18 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  39.75 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  32.4 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  36.65 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1218  regulatory protein DeoR  44.69 
 
 		 205 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658243  decreased coverage  0.00388066 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  37.93 
 
 		 233 aa  142  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  32.93 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  37.34 
 
 		 257 aa  138  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  39.34 
 
 		 267 aa  138  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  39.76 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  37.4 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2567  DeoR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2517  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0400027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  40.23 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2578  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000422866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2534  DeoR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000015777  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 251 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2765  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595912  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  37.56 
 
 		 267 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2772  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0124303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2776  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  39.08 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  36.29 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2498  DeoR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0137316  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  37.7 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  37.14 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2819  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0209675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  35.5 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  36.89 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  34.91 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 254 aa  131  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 251 aa  131  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  29.76 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2798  DeoR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0120141  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  34.19 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  34.05 
 
 		 248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  36.64 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  37.32 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  38.79 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  35.34 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4986  transcriptional regulator, DeoR family  35.57 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0285298  normal  0.0212972 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2920  transcriptional regulator, DeoR family  35.78 
 
 		 256 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  38.2 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  35.06 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>