More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5310 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 253 aa  497  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 252 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 252 aa  268  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  49.6 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  46.43 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  46.25 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 253 aa  211  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  45.06 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  45.85 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  49.36 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  43.08 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  44.53 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  44.21 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  38.43 
 
 		 255 aa  151  8e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 259 aa  151  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  39.83 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  36.21 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  33.07 
 
 		 250 aa  138  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  34.51 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  34.51 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  34.51 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 254 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  34.51 
 
 		 259 aa  135  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  35.44 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  32.48 
 
 		 233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  37.18 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  35.15 
 
 		 257 aa  125  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 261 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  34.44 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  36.91 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  28.86 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  34.02 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  34.02 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  34.02 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 264 aa  121  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  31.33 
 
 		 248 aa  121  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  34.6 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  31.05 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  38.17 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  30.3 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0039  transcriptional regulator, DeoR family  30.29 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000112771  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  119  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  34.33 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  33.63 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  31.9 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  36.21 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.03 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 253 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.05 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  31.1 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  32.22 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  30.49 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2567  DeoR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.2 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  31.65 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  31.3 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2534  DeoR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 256 aa  111  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000015777  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.65 
 
 		 259 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  32.06 
 
 		 253 aa  111  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.65 
 
 		 259 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.65 
 
 		 259 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.65 
 
 		 259 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 253 aa  111  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.65 
 
 		 259 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  29.15 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  29.66 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.39 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.66 
 
 		 252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.66 
 
 		 252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>