More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0997 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 267 aa  541  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  74.24 
 
 		 264 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  43.03 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  44.26 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  38.65 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  41 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  35.43 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  41.77 
 
 		 282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  41.7 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  39.43 
 
 		 253 aa  162  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  36.96 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  37.45 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  36.25 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  36.25 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.25 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  36.25 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.25 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.25 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.25 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  38.3 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  41.53 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  39 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.25 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  40.23 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  38 
 
 		 254 aa  155  9e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  39.92 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  39.52 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.25 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  35.34 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  40.77 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 255 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 255 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 255 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  39.33 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  39.33 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  39.33 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  39.33 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  39.33 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  34.01 
 
 		 258 aa  148  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  35.43 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  39.06 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  39.04 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  36.51 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  36.51 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  37.85 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  37.85 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  37.85 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  37.85 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  36.51 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  36.51 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  36.51 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  36.47 
 
 		 268 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  36.51 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  35.94 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  36.51 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  39.83 
 
 		 252 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  35.16 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  34.39 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  36.11 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.46 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  40.08 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  39.24 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  38.43 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  37.45 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  36.51 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  34.24 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  36.11 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  38.62 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2958  transcriptional regulator, DeoR family  37.7 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00162277  decreased coverage  0.000126005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  38.24 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  38.24 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  38.24 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  38.24 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  36.18 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  39.91 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  38.24 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  37.31 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  37.66 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>